More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1190 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  39.3 
 
 
212 aa  162  4e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.51 
 
 
223 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  45.5 
 
 
228 aa  156  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4494  HAD family hydrolase  46.77 
 
 
217 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.901613 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  38.69 
 
 
223 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.66 
 
 
228 aa  146  2e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  35.75 
 
 
222 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0113  HAD family hydrolase  44.05 
 
 
215 aa  141  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254082  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  42.36 
 
 
225 aa  141  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  44.19 
 
 
218 aa  140  1e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4274  6-phosphogluconate phosphatase  34.31 
 
 
221 aa  135  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  42.22 
 
 
227 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  39.71 
 
 
230 aa  134  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4082  6-phosphogluconate phosphatase  35.29 
 
 
221 aa  132  4e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.580327 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4188  6-phosphogluconate phosphatase  39.13 
 
 
222 aa  131  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.274934  hitchhiker  0.00681346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4162  6-phosphogluconate phosphatase  40.1 
 
 
222 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  36.71 
 
 
233 aa  131  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4240  6-phosphogluconate phosphatase  39.5 
 
 
222 aa  131  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.09 
 
 
228 aa  130  1e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5146  6-phosphogluconate phosphatase  35.29 
 
 
221 aa  130  1e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.107109 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4252  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.31 
 
 
221 aa  129  2e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4224  6-phosphogluconate phosphatase  34.31 
 
 
221 aa  129  2e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  43.35 
 
 
217 aa  130  2e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3929  6-phosphogluconate phosphatase  34.31 
 
 
221 aa  129  2e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03599  predicted hydrolase  34.31 
 
 
221 aa  129  2e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4279  6-phosphogluconate phosphatase  34.31 
 
 
221 aa  129  2e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03543  hypothetical protein  34.31 
 
 
221 aa  129  2e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4077  6-phosphogluconate phosphatase  35.78 
 
 
221 aa  129  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.18 
 
 
231 aa  128  4e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  44.51 
 
 
245 aa  128  5e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  40.69 
 
 
217 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0020  6-phosphogluconate phosphatase  36.18 
 
 
221 aa  128  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4142  6-phosphogluconate phosphatase  34.31 
 
 
221 aa  127  1e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  35.58 
 
 
260 aa  127  2e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  35.58 
 
 
244 aa  126  2e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  35.58 
 
 
244 aa  126  2e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  40.46 
 
 
225 aa  126  2e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  35.58 
 
 
228 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  41.67 
 
 
223 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
223 aa  125  4e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.42 
 
 
232 aa  125  4e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4240  6-phosphogluconate phosphatase  34.8 
 
 
221 aa  124  8e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0636361  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  41.62 
 
 
242 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4133  6-phosphogluconate phosphatase  34.8 
 
 
221 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0258255  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  37.62 
 
 
208 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4594  6-phosphogluconate phosphatase  33.82 
 
 
221 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.348928  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  39.66 
 
 
248 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4061  6-phosphogluconate phosphatase  34.31 
 
 
221 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4183  6-phosphogluconate phosphatase  34.31 
 
 
221 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201399  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  34.62 
 
 
228 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.35 
 
 
219 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  34.62 
 
 
240 aa  121  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  34.62 
 
 
240 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  37.5 
 
 
224 aa  121  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  41.62 
 
 
222 aa  121  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  38.35 
 
 
216 aa  120  1e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  35.71 
 
 
228 aa  120  2e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  35.24 
 
 
240 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  35.59 
 
 
230 aa  119  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  39.66 
 
 
228 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05938  hypothetical protein  35.2 
 
 
237 aa  117  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  35.24 
 
 
228 aa  117  1e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  35.24 
 
 
228 aa  117  1e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.89 
 
 
223 aa  117  1e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  35.24 
 
 
228 aa  117  1e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  35.1 
 
 
252 aa  117  1e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  39.31 
 
 
228 aa  117  1e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  35.24 
 
 
228 aa  117  1e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  42.77 
 
 
219 aa  117  1e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  35.24 
 
 
228 aa  117  1e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  35.24 
 
 
228 aa  117  2e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000204  putative phosphatase YieH  35.39 
 
 
222 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.30106  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.76 
 
 
228 aa  115  4e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  39.08 
 
 
228 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  37.71 
 
 
231 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  40.1 
 
 
227 aa  114  1e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  36.76 
 
 
240 aa  113  2e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.13 
 
 
223 aa  113  2e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3445  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.62 
 
 
229 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  37.98 
 
 
235 aa  110  1e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.04 
 
 
229 aa  110  1e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0442  HAD family hydrolase  36.89 
 
 
218 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  38.29 
 
 
228 aa  109  4e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  38.29 
 
 
228 aa  109  4e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  33.17 
 
 
214 aa  108  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.29 
 
 
237 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  36.89 
 
 
224 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.83 
 
 
214 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  38.05 
 
 
232 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  37.56 
 
 
232 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  37.56 
 
 
232 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  38.05 
 
 
232 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  37.56 
 
 
232 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  37.56 
 
 
232 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  33.98 
 
 
230 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  35.26 
 
 
237 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  32.21 
 
 
229 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  38.17 
 
 
227 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  37.75 
 
 
232 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>