More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1167 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1167  putative dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 314 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3437  dihydrodipicolinate synthetase  67.96 
 
 		 310 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0930984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3342  dihydrodipicolinate synthetase  68.28 
 
 		 312 aa  411  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0058629  normal  0.508652 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1393  dihydrodipicolinate synthetase  67.96 
 
 		 312 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5676  dihydrodipicolinate synthetase  67.74 
 
 		 312 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0631  dihydrodipicolinate synthetase  43.32 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000301226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4933  dihydrodipicolinate synthetase  36.52 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3227  dihydrodipicolinate synthetase  36.52 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1566  dihydrodipicolinate synthetase  36.88 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6740  dihydrodipicolinate synthetase  36.88 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6264  dihydrodipicolinate synthetase  36.88 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5282  dihydrodipicolinate synthetase  36.17 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3377  dihydrodipicolinate synthetase  35.11 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0071  dihydrodipicolinate synthase  34.32 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3161  dihydrodipicolinate synthetase  33.66 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0466092 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02600  dihydrodipicolinate synthase DapA, putative  34.16 
 
 		 383 aa  155  8e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2683  dihydrodipicolinate synthetase  32.27 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02728  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00110)  33 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.753115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0601  dihydrodipicolinate synthetase  31.35 
 
 		 308 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6215  dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6384  dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 		 318 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6617  dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 		 318 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.242372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0687  dihydrodipicolinate synthetase  34.23 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0101529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1603  dihydrodipicolinate synthetase  32.45 
 
 		 337 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0929  dihydrodipicolinate synthetase  31.02 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.626944 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  27.73 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2368  dihydrodipicolinate synthetase  29.41 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5472  dihydrodipicolinate synthetase  27.01 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  26.86 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  28.24 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  27.84 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  27.84 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  27.84 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  27.84 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  27.84 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  27.84 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  27.84 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  27.84 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8494  dihydrodipicolinate synthase  25.85 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  28.95 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  27.63 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2739  dihydrodipicolinate synthetase  27.16 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145378  normal  0.165925 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  24.82 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  28.25 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  25.86 
 
 		 291 aa  94.4  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  26.3 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.65 
 
 		 313 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  28.63 
 
 		 294 aa  92.8  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  26.89 
 
 		 371 aa  92.8  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4686  dihydrodipicolinate synthetase  27.27 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 293 aa  92.4  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  27.5 
 
 		 293 aa  92.4  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  27.5 
 
 		 293 aa  92.4  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  27.56 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  27.81 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  25.75 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  28.24 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  28.39 
 
 		 296 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  25.25 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4793  dihydrodipicolinate synthetase  27.42 
 
 		 305 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  25.08 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  25.08 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4685  dihydrodipicolinate synthetase  27.92 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  25.08 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  25.08 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  25.08 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  26.56 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0532  dihydrodipicolinate synthase, putative  23.01 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 		 294 aa  87  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  24.5 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  24.46 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  26.47 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  22.55 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.54 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  27.46 
 
 		 288 aa  85.9  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0406  dihydrodipicolinate synthase family protein  25.65 
 
 		 305 aa  85.9  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0349  dihydrodipicolinate synthase family protein  25.65 
 
 		 320 aa  85.9  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  24.17 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  23.78 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  24.17 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  24.42 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  24.17 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  24.17 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  24.17 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  27.3 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  24.17 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1453  putative dihydrodipicolinate synthase  23.01 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  25.41 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  24.35 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  27.04 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  24.19 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  26.4 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  27.84 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  24.19 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  23.84 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  21.61 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  21.61 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>