141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1164 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  100 
 
 		 154 aa  303  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  57.66 
 
 		 157 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  57.66 
 
 		 157 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  57.55 
 
 		 152 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  57.35 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  53.1 
 
 		 159 aa  157  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  55.15 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  51.01 
 
 		 153 aa  153  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  52.63 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  52.38 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  52.9 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  51.95 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  47.68 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  45.95 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  47.95 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  45 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  48.92 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  45.95 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.36 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  41.36 
 
 		 173 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  42.95 
 
 		 174 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.36 
 
 		 173 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  42.95 
 
 		 168 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.16 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.34 
 
 		 196 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.91 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.85 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  36.54 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  38.06 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  32.24 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.87 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  34.81 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.57 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.28 
 
 		 169 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  32.85 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.92 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.12 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  53.23 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  42.22 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  30.54 
 
 		 168 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  30 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.01 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  30.87 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  29.25 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  29.75 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  32 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  32.91 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  32.9 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  27.33 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  26.67 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.01 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  33.13 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  28.28 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.33 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.57 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.23 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.74 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  29.75 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03671  hypothetical protein  48.33 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  32.93 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.56 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.73 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.22 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  30.66 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.62 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  29.58 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  30.3 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  32.03 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  24.68 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  31.37 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  30.86 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.09 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  26.75 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  29.09 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  29.3 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  26.92 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.77 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.85 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  28.77 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  29.41 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  30.26 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.93 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  33.58 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.86 
 
 		 168 aa  51.2  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.08 
 
 		 186 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.14 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.58 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  27.14 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  29.66 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  39.02 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  28.48 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  28.48 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  28.48 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.03 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  28.48 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.22 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  27.81 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>