More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1158 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  100 
 
 		 971 aa  1979    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  37.4 
 
 		 989 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  35.99 
 
 		 997 aa  563  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  26.7 
 
 		 994 aa  314  5.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  28.26 
 
 		 987 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  25.4 
 
 		 722 aa  107  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  35.33 
 
 		 674 aa  82  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  27.85 
 
 		 756 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  35.46 
 
 		 738 aa  79.7  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  29.52 
 
 		 720 aa  70.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  33.33 
 
 		 796 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  28.31 
 
 		 719 aa  68.6  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 748 aa  64.7  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  31.4 
 
 		 587 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4587  histidine kinase  24.89 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  30.58 
 
 		 587 aa  63.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  31.4 
 
 		 587 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 587 aa  62.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  29.75 
 
 		 587 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  31.4 
 
 		 587 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  29.75 
 
 		 587 aa  61.6  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  29.75 
 
 		 587 aa  61.6  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  29.75 
 
 		 587 aa  61.6  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  29.75 
 
 		 587 aa  61.6  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  25.75 
 
 		 1187 aa  61.2  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 441 aa  61.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18234  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  34.25 
 
 		 723 aa  60.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 839 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472941  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  39.24 
 
 		 679 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4893  sporulation kinase  24.88 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  24.19 
 
 		 567 aa  58.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 585 aa  58.5  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  26.22 
 
 		 771 aa  58.2  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 531 aa  57.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2299  histidine kinase  30.66 
 
 		 542 aa  57.4  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  35.24 
 
 		 609 aa  57.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4894  putative sensor histidine kinase  23.92 
 
 		 406 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 		 471 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 654 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 657 aa  57  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 630 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  29.41 
 
 		 774 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0347  sporulation kinase  24.88 
 
 		 406 aa  57  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  34.48 
 
 		 659 aa  55.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0604  sensor histidine kinase  23.22 
 
 		 434 aa  56.2  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5323  histidine kinase  31.9 
 
 		 783 aa  55.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  25.18 
 
 		 445 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  30.5 
 
 		 662 aa  55.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  25.24 
 
 		 1384 aa  55.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 470 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2555  histidine kinase  39.47 
 
 		 635 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.99 
 
 		 963 aa  55.1  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4528  sensor histidine kinase  23.44 
 
 		 406 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.969136  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 676 aa  55.1  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10947  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5615  histidine kinase  36.9 
 
 		 429 aa  55.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 886 aa  54.7  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 496 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4509  sensor histidine kinase  22.77 
 
 		 406 aa  53.9  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184218  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  35.29 
 
 		 457 aa  54.3  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 476 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 		 971 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4603  histidine kinase  23.86 
 
 		 405 aa  54.3  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 475 aa  53.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0021  histidine kinase  35.85 
 
 		 485 aa  53.5  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  26.06 
 
 		 430 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3152  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.29 
 
 		 473 aa  53.5  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 679 aa  53.5  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  24.07 
 
 		 946 aa  53.5  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0676  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 576 aa  53.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.268239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  22.88 
 
 		 363 aa  53.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  26.06 
 
 		 430 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 683 aa  53.5  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  33.67 
 
 		 305 aa  53.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  30.48 
 
 		 1061 aa  53.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 850 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 381 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4668  sensor histidine kinase  22.97 
 
 		 406 aa  52.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304477  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  25.23 
 
 		 621 aa  53.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 733 aa  52.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5028  sensor histidine kinase  22.97 
 
 		 406 aa  52.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 597 aa  52.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 483 aa  52.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 1691 aa  53.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 565 aa  52.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 590 aa  52.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  30.83 
 
 		 355 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2683  ATP-binding region ATPase domain protein  31.82 
 
 		 746 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.301078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  27.11 
 
 		 774 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0696  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 570 aa  52.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 461 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0403  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 		 374 aa  52.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 478 aa  52  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2491  histidine kinase  25.41 
 
 		 626 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653758 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 850 aa  52.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 462 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 904 aa  52  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3846  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 352 aa  52  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 756 aa  52  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7077  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 480 aa  51.6  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.871735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>