122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1111 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  100 
 
 		 481 aa  978    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1468  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.85 
 
 		 484 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827957 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3577  FAD linked oxidase-like  58.13 
 
 		 495 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.310441  normal  0.085604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1591  twin-arginine translocation pathway signal  54.14 
 
 		 497 aa  486  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.190202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  29.71 
 
 		 481 aa  203  5e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  27.41 
 
 		 475 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  28.23 
 
 		 478 aa  189  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  27.61 
 
 		 468 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  27.8 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  28.45 
 
 		 478 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  28.08 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  28.45 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  28.02 
 
 		 478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  28.02 
 
 		 471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  27.59 
 
 		 478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.8 
 
 		 490 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  29.11 
 
 		 761 aa  176  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  30.52 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  32.82 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  37.63 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  31.02 
 
 		 438 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  34.44 
 
 		 596 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.76 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  34.93 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.45 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  36 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  25.13 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  26.72 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.5 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2688  FAD linked oxidase domain protein  32.74 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.70388  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  29.37 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.87 
 
 		 726 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  31.76 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  33.33 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  33.85 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  30.91 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  25 
 
 		 434 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  25.58 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  30.36 
 
 		 436 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  26.67 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  24.62 
 
 		 437 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  31.25 
 
 		 491 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  24.17 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  29.2 
 
 		 470 aa  54.3  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  29.6 
 
 		 433 aa  53.9  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  23.61 
 
 		 448 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  32.26 
 
 		 442 aa  53.9  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  28.07 
 
 		 452 aa  53.9  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2915  FAD linked oxidase domain protein  30.63 
 
 		 455 aa  53.5  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000548663  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  31.85 
 
 		 752 aa  53.5  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.05 
 
 		 432 aa  53.5  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  23.85 
 
 		 437 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  32.43 
 
 		 473 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.57 
 
 		 445 aa  53.1  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  24.57 
 
 		 452 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  31.47 
 
 		 449 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.75 
 
 		 483 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  25.21 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.18 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  29.19 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  27.48 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  28.83 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  28.83 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  29.82 
 
 		 578 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  36.62 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  26.79 
 
 		 452 aa  51.2  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.51 
 
 		 460 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  33.33 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  27.74 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  24.37 
 
 		 437 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  24.37 
 
 		 437 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.76 
 
 		 734 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  25.28 
 
 		 424 aa  51.2  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.36 
 
 		 462 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  27.34 
 
 		 447 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.98 
 
 		 447 aa  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  25.97 
 
 		 456 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.97 
 
 		 456 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.97 
 
 		 456 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.86 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  30.23 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  23.48 
 
 		 437 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  26.88 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.07 
 
 		 437 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  24.7 
 
 		 572 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  26.62 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  27.46 
 
 		 468 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  30 
 
 		 432 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08967  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14300)  39.62 
 
 		 497 aa  47.4  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.557658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  24.44 
 
 		 445 aa  47.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  21.74 
 
 		 474 aa  47.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  31.69 
 
 		 478 aa  47  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  24.32 
 
 		 425 aa  47  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  29.79 
 
 		 446 aa  47.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  34.62 
 
 		 434 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  23.26 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>