88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1048 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 420 aa  866    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  60.1 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  54.57 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  52.71 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  52.18 
 
 		 415 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  52.22 
 
 		 413 aa  441  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  52.83 
 
 		 409 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  52.58 
 
 		 409 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  51.24 
 
 		 420 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  52.33 
 
 		 408 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  52.33 
 
 		 409 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  52.46 
 
 		 409 aa  425  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  50.5 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  51.74 
 
 		 407 aa  422  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  52.39 
 
 		 400 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  50 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  50.49 
 
 		 411 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  49.14 
 
 		 408 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  49.51 
 
 		 411 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  52.84 
 
 		 407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  48.4 
 
 		 411 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  50.61 
 
 		 416 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  49.63 
 
 		 407 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  48.89 
 
 		 407 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  48.64 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  48.64 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  47.77 
 
 		 411 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  49 
 
 		 406 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  47.63 
 
 		 407 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  54.1 
 
 		 373 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  47.92 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  47.25 
 
 		 413 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  49.1 
 
 		 410 aa  362  5.0000000000000005e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  44.59 
 
 		 402 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  45.34 
 
 		 413 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  46.42 
 
 		 444 aa  328  9e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  45.45 
 
 		 427 aa  310  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  43.32 
 
 		 415 aa  307  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  41.48 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  41.67 
 
 		 410 aa  289  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  38.29 
 
 		 409 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  41.5 
 
 		 410 aa  282  8.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  36.66 
 
 		 407 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  36.08 
 
 		 419 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  33.25 
 
 		 408 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  33.33 
 
 		 408 aa  226  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  33 
 
 		 406 aa  226  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  34.23 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.1 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  30.53 
 
 		 418 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  30.88 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  31.25 
 
 		 400 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  31 
 
 		 400 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  27.34 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  26.97 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  28.01 
 
 		 409 aa  179  9e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  31.03 
 
 		 400 aa  169  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  30.03 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  27.1 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  27.1 
 
 		 412 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  25.5 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  29.29 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  40.15 
 
 		 178 aa  90.5  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  25.78 
 
 		 817 aa  89.7  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  24.32 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  24.81 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  23.08 
 
 		 396 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  23.62 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  23.71 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  23.94 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  27.17 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  28.73 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  23.14 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  21.64 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  21.32 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  25.5 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  20.82 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  30.88 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  23.17 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  23.94 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  25.13 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  19.94 
 
 		 378 aa  50.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  23.71 
 
 		 383 aa  49.7  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  25.36 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  25.36 
 
 		 303 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  23.08 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.53 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>