More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1007 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 336 aa  695    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  55.91 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  55.91 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  56.23 
 
 		 318 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  55.27 
 
 		 318 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  43.94 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  37.03 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  43.02 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  41.29 
 
 		 312 aa  206  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  39.49 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 		 705 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  37.02 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  38.53 
 
 		 652 aa  175  8e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 298 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.61 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  34.9 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  39.26 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  31.99 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 		 714 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 		 333 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.52 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  37.24 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 		 327 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 		 327 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.6 
 
 		 311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 		 342 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 		 290 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  34.24 
 
 		 282 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  32.92 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  32.34 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  32.34 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 		 308 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0899  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  27.46 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  27.57 
 
 		 301 aa  113  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  29.92 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2292  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  31.75 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.56 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3552  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0457  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 		 297 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  28.41 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 679 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  32.81 
 
 		 1837 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 275 aa  103  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  28.01 
 
 		 340 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 		 342 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 		 691 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2507  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 		 221 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 		 691 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  32.4 
 
 		 691 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>