234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0988 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  704    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  32.67 
 
 		 356 aa  91.3  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  29.19 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  32.23 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  25.75 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  28.08 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  35.19 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  35.53 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  26.74 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  27.35 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  27.78 
 
 		 386 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  35.68 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  25 
 
 		 584 aa  66.6  0.0000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1160  acyltransferase 3  29.63 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.287557  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  28.35 
 
 		 667 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  27.79 
 
 		 634 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  31 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  26.32 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  24.16 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  27.27 
 
 		 640 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5770  acyltransferase 3  29.82 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  32.12 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  29.59 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.73 
 
 		 639 aa  61.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  26.79 
 
 		 679 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  26.78 
 
 		 690 aa  60.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  27.4 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  24.35 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  29.49 
 
 		 681 aa  60.1  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  37.11 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  26.03 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0016  acyltransferase 3  25.92 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  27.86 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  24.14 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  32.92 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  28.57 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  25.78 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  29.69 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  25.89 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  24.65 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  24 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23320  predicted acyltransferase  31.4 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  31.01 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  33.54 
 
 		 635 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  27.65 
 
 		 759 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  33.74 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  28.3 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4121  acyltransferase 3  27.25 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184314  normal  0.5023 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  31.6 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  28.26 
 
 		 684 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  31.65 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  28.83 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  27.85 
 
 		 695 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  25.82 
 
 		 635 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  30.07 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2593  hypothetical protein  25.68 
 
 		 409 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.110945  normal  0.12741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1300  acyltransferase 3  33.33 
 
 		 374 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  25.95 
 
 		 636 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  26.48 
 
 		 658 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0149  cellulose-binding family II protein  30.19 
 
 		 362 aa  53.5  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  26.15 
 
 		 603 aa  53.1  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  26.15 
 
 		 603 aa  53.1  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  25.25 
 
 		 397 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  25.25 
 
 		 397 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1385  acyltransferase 3  24.12 
 
 		 635 aa  52.8  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2069  acyltransferase 3  42.53 
 
 		 376 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  25.3 
 
 		 437 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  30.19 
 
 		 381 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  24.14 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  31.03 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1348  acyltransferase 3  26.74 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  decreased coverage  0.000177044 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2970  acyltransferase 3  27.24 
 
 		 528 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  28.02 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1252  acyltransferase 3  26.02 
 
 		 673 aa  52.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  27.54 
 
 		 695 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  26.14 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  24.72 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  26.63 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  30.43 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  27.73 
 
 		 665 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  32 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  32 
 
 		 408 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  28.45 
 
 		 622 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  23.37 
 
 		 321 aa  50.8  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  26.43 
 
 		 643 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  26.75 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0214  acyltransferase 3  28.09 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.855839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  29.89 
 
 		 621 aa  50.8  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  26.75 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  27.19 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  28.22 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  40.96 
 
 		 695 aa  50.4  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15660  predicted acyltransferase  24.75 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0706  acyltransferase 3  33.94 
 
 		 243 aa  50.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  26.28 
 
 		 660 aa  50.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1470  acyltransferase 3  27.67 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0978783  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2651  acyltransferase 3  25.94 
 
 		 363 aa  50.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  31.87 
 
 		 360 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  27.78 
 
 		 654 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  41.46 
 
 		 651 aa  49.7  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>