230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0946 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  100 
 
 		 243 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  64.44 
 
 		 229 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  61.71 
 
 		 229 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  55.97 
 
 		 230 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  59.26 
 
 		 229 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  57.68 
 
 		 228 aa  255  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  54.63 
 
 		 224 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  53.42 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  53.42 
 
 		 227 aa  234  7e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  53.42 
 
 		 227 aa  234  7e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  53.78 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  50.21 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  44.58 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  47.8 
 
 		 243 aa  191  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  45.97 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  44.67 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  45.07 
 
 		 214 aa  158  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  42.37 
 
 		 204 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  40.93 
 
 		 195 aa  148  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  40.93 
 
 		 195 aa  148  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  38.61 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  40 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  40.91 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  42.03 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  40.41 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  40.1 
 
 		 222 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  41 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  38.87 
 
 		 215 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  41.12 
 
 		 216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  42.05 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  42.05 
 
 		 214 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  42.05 
 
 		 214 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  37.16 
 
 		 219 aa  133  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  42.05 
 
 		 214 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  38.07 
 
 		 221 aa  133  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  42.05 
 
 		 214 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  42.05 
 
 		 214 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  37.62 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  42.05 
 
 		 194 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  42.05 
 
 		 194 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  38.58 
 
 		 218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  36.8 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  40 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2579  OmpW  37.37 
 
 		 228 aa  128  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.793769  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  38.83 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  39.2 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  39.2 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  39.2 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  39.2 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  39.2 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  39.2 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  34.84 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  39.2 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  32.64 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  36.05 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  42.64 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  35.85 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  37.57 
 
 		 216 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  34.8 
 
 		 227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  36.15 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  36.32 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  35.81 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  39.9 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  37.13 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  37.13 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  31.34 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0434  OmpW family protein  28.84 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587861  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  35.15 
 
 		 200 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  35.85 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  37.95 
 
 		 215 aa  99.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  35.05 
 
 		 227 aa  98.6  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1749  OmpW family protein  32.83 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  31.76 
 
 		 217 aa  95.5  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2085  OmpW family protein  31.66 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  hitchhiker  0.00113092 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  34.17 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0436  OmpW family protein  29.71 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.322877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  30.77 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  34.72 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  31.71 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1677  OmpW  31.34 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  32.53 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  35.23 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3010  putative outer membrane protein W  33.7 
 
 		 208 aa  92.4  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  32.11 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  31.34 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  31.34 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  31.34 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  37.27 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  30 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  30 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  35.98 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  35.98 
 
 		 215 aa  89.7  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0155  OmpW family protein  35.71 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  36.94 
 
 		 215 aa  89  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  35.11 
 
 		 211 aa  89  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  31.31 
 
 		 213 aa  88.6  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  33.03 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  37.8 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  29.58 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  28.28 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>