More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0918 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
335 aa  678    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  70.87 
 
 
333 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  69.37 
 
 
332 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  69.07 
 
 
332 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  69.67 
 
 
332 aa  464  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  69.97 
 
 
332 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  68.77 
 
 
332 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  68.98 
 
 
332 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  68.47 
 
 
332 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  68.77 
 
 
332 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  68.56 
 
 
334 aa  448  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  66.07 
 
 
332 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  67.27 
 
 
336 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  66.97 
 
 
332 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  65.17 
 
 
338 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  61.86 
 
 
333 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  66.77 
 
 
334 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  65.57 
 
 
334 aa  431  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  63.66 
 
 
336 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  61.86 
 
 
333 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.66 
 
 
333 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.06 
 
 
333 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  59.4 
 
 
334 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  58.86 
 
 
333 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.98 
 
 
333 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  59.28 
 
 
333 aa  401  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.68 
 
 
333 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  56.46 
 
 
332 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  60.43 
 
 
325 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  61.78 
 
 
349 aa  393  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  55.15 
 
 
372 aa  388  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  58.38 
 
 
341 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  54.52 
 
 
378 aa  388  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  57.06 
 
 
342 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  58.9 
 
 
325 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  56.68 
 
 
338 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  56.89 
 
 
342 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  54.55 
 
 
370 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  59.52 
 
 
333 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  54.27 
 
 
370 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  58.18 
 
 
330 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  56.59 
 
 
333 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  53.99 
 
 
370 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  55.56 
 
 
365 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  54.6 
 
 
367 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  54.78 
 
 
369 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  53.19 
 
 
368 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  53.78 
 
 
362 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  54.95 
 
 
344 aa  368  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  57.93 
 
 
334 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  51.67 
 
 
371 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  53.69 
 
 
363 aa  364  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  53.5 
 
 
362 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  54.65 
 
 
359 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  53.61 
 
 
369 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  53.95 
 
 
358 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  54.08 
 
 
358 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  54.37 
 
 
357 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  50 
 
 
364 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  51.79 
 
 
379 aa  364  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.31 
 
 
369 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  53.09 
 
 
359 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  51.09 
 
 
381 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  53.74 
 
 
361 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  53.06 
 
 
369 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  53.15 
 
 
391 aa  363  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  55.2 
 
 
345 aa  363  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  53.06 
 
 
368 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  53.06 
 
 
368 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.65 
 
 
365 aa  362  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  53.33 
 
 
369 aa  362  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  55.94 
 
 
351 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.33 
 
 
370 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.33 
 
 
370 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.33 
 
 
370 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.33 
 
 
370 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.33 
 
 
370 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  53.06 
 
 
375 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 
370 aa  361  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.33 
 
 
388 aa  361  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  52.78 
 
 
369 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  53.56 
 
 
363 aa  360  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  51.94 
 
 
362 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  52.94 
 
 
362 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.47 
 
 
351 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  52.22 
 
 
369 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  52.78 
 
 
369 aa  359  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4987  ABC transporter related  52.79 
 
 
371 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  52.09 
 
 
361 aa  358  5e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  50.54 
 
 
381 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  54.28 
 
 
350 aa  357  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  53.06 
 
 
369 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  52.94 
 
 
362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.61 
 
 
370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  51.94 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  52.71 
 
 
364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  55.45 
 
 
331 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 
371 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  53.31 
 
 
355 aa  355  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  51.26 
 
 
366 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>