173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0866 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  100 
 
 		 243 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  57.49 
 
 		 236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  55.33 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  56.45 
 
 		 240 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  56.05 
 
 		 237 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  55.82 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  55.28 
 
 		 236 aa  245  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  55.12 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  52.73 
 
 		 242 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  61.64 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  52.57 
 
 		 238 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  51.84 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  55.33 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  52.28 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1337  putative outer membrane protein  54.93 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  48.95 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  40.55 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  41.96 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  37.45 
 
 		 559 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  38.71 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  37.97 
 
 		 562 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  40.54 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  40.39 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  40.7 
 
 		 248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  35.52 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  37.78 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  40.09 
 
 		 561 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1567  putative outer-membrane protein precursor  37.5 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  35.93 
 
 		 566 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  35.32 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  36.74 
 
 		 447 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  36.36 
 
 		 452 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  35.14 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  35.02 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  34.47 
 
 		 570 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  35.81 
 
 		 997 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  36.75 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  36.76 
 
 		 453 aa  101  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  36.86 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  34.12 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4376  putative outer-membrane protein  35.96 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36541  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  33.21 
 
 		 570 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  33.33 
 
 		 652 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  34.27 
 
 		 449 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  35.29 
 
 		 454 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 		 692 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  35.25 
 
 		 571 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  34.34 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  36.94 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  32.95 
 
 		 254 aa  91.7  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3979  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.72 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  30.49 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2080  putative outer-membrane protein precursor  37.55 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.366829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  32.13 
 
 		 670 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  35.55 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  32.65 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  34.31 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  35.32 
 
 		 232 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  31.82 
 
 		 449 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  35.35 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  31.84 
 
 		 645 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  35.05 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  30.74 
 
 		 638 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  32.95 
 
 		 578 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  30.16 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  30.61 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1543  putative outer-membrane protein  29.44 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  33.95 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  28.2 
 
 		 693 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  31.19 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  34 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  33.92 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  30.95 
 
 		 710 aa  79  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  31.75 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6718  hypothetical protein  37.58 
 
 		 550 aa  78.6  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  31.03 
 
 		 689 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4525  putative outer-membrane protein  33.86 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  28.45 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.33 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  28.45 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  32.52 
 
 		 661 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  33.17 
 
 		 662 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  33.76 
 
 		 206 aa  72  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  29.55 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  31.84 
 
 		 674 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  31.58 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.72 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  29.58 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2763  putative outer-membrane protein precursor  33.19 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  33.33 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3415  putative outer membrane protein of unknown function  30.08 
 
 		 680 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  29.95 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.48 
 
 		 206 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  29.38 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  31.45 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  29.33 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  30.58 
 
 		 577 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.43 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  32.69 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  29.33 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>