267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0819 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  327  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  85.28 
 
 		 189 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  92.52 
 
 		 165 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  83.44 
 
 		 163 aa  278  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  82.1 
 
 		 162 aa  271  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  88.44 
 
 		 189 aa  270  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  54.29 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  51.77 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  38.14 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 151 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 151 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 151 aa  85.1  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  37.6 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0295  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  33.33 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  36.27 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  32.84 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  34.17 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  34.17 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  34.68 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  28.36 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  35.92 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  32.3 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  31.3 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  26.72 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  24.31 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  24.31 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 203 aa  50.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  24.31 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  36.44 
 
 		 182 aa  50.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  24.31 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  28.89 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  34 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>