208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0807 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0807  putative permease  100 
 
 
308 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  81.11 
 
 
308 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  80.26 
 
 
343 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  79.15 
 
 
307 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  75.24 
 
 
320 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  76.55 
 
 
307 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  80.92 
 
 
308 aa  411  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  63.73 
 
 
307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  56.81 
 
 
305 aa  329  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  57.48 
 
 
308 aa  326  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  55.15 
 
 
307 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  54.82 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  55.48 
 
 
307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  53.11 
 
 
307 aa  297  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  52.15 
 
 
307 aa  296  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  57.81 
 
 
306 aa  295  8e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  56.86 
 
 
316 aa  291  9e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  56.86 
 
 
316 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  52.48 
 
 
310 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  50.66 
 
 
306 aa  288  7e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  52.16 
 
 
306 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  52.16 
 
 
306 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  49.67 
 
 
330 aa  278  9e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  52.82 
 
 
306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  55.08 
 
 
307 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  55.88 
 
 
307 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  50.33 
 
 
307 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  43.19 
 
 
315 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  50.5 
 
 
307 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  45.7 
 
 
304 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  42.81 
 
 
304 aa  212  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  39.47 
 
 
305 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  43.96 
 
 
312 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  39.59 
 
 
296 aa  199  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  40.2 
 
 
303 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  40.8 
 
 
301 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  32.46 
 
 
313 aa  152  7e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  36.4 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  30.5 
 
 
352 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  30.63 
 
 
356 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  29.41 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  32.17 
 
 
394 aa  89.4  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  28.47 
 
 
420 aa  89  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  31.12 
 
 
339 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  24.01 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  27.65 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  28.67 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  23.44 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  26.06 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  23.68 
 
 
257 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  25.76 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  27.04 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  25.86 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  24.69 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  30.63 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  26.6 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  29.18 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  24.63 
 
 
356 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  25.09 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  29.56 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  24.62 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  25.69 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  27.11 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  25.98 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  25.8 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  24.48 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  26.88 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  24.23 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  30.86 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  24.35 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25.69 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  22.22 
 
 
257 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  25.9 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  24.71 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  24.56 
 
 
251 aa  62.8  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  24.56 
 
 
251 aa  62.8  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  26.33 
 
 
2798 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  24.04 
 
 
443 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  32.31 
 
 
355 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  22.78 
 
 
257 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  23.94 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  27.31 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  24.3 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  24.3 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0872  hypothetical protein  25.52 
 
 
254 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  27.9 
 
 
255 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  23.27 
 
 
264 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  28.44 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  28.44 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2888  protein of unknown function DUF81  25.82 
 
 
260 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  25.68 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  25.68 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  26.79 
 
 
261 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  34.65 
 
 
263 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  26.38 
 
 
269 aa  56.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  27.4 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  25.91 
 
 
263 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  26.98 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  24.29 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1313  hypothetical protein  28.96 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.607522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>