More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0805 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  100 
 
 		 304 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  73.94 
 
 		 312 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  69.23 
 
 		 312 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.28 
 
 		 306 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  47.26 
 
 		 309 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  32.26 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.77 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  31.75 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  31.06 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  31.29 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  30.25 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  31.9 
 
 		 293 aa  99  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  32.64 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  31.9 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.36 
 
 		 290 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 		 348 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  34.16 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  31.23 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  30.8 
 
 		 305 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2802  hypothetical protein  31.9 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  31.23 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  29.35 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  27.27 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  32.01 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  34.09 
 
 		 281 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  28.71 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  30.32 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.71 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  26.07 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  28.11 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  30.66 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  30.31 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.45 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.25 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.68 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  25 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  27.05 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.4 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  29.18 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  29.26 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  28.87 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.62 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  30.5 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  26.26 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.54 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  28.78 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  28.82 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  29.13 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  33.09 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  31.54 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4196  hypothetical protein  28.78 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.73 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  25.81 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  28.67 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  24.48 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  28.62 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  26.79 
 
 		 364 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  29.86 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  26.57 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.69 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.35 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  29.35 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  26.69 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  27.7 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  24.74 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  29.34 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  26.01 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  26.01 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  26.01 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  26.01 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  30.85 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  26.01 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  26.01 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  30.85 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  28.19 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  26.74 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  24.6 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  31.47 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>