More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0779 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 614 aa  1239    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  53.4 
 
 		 616 aa  596  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  51.56 
 
 		 609 aa  581  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  51.8 
 
 		 609 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  50.56 
 
 		 647 aa  562  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  48.33 
 
 		 602 aa  538  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  48.58 
 
 		 620 aa  528  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  44.9 
 
 		 645 aa  523  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  47.11 
 
 		 605 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  43.71 
 
 		 663 aa  511  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  44.67 
 
 		 601 aa  500  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  46.88 
 
 		 602 aa  480  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  44.61 
 
 		 509 aa  415  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  40.98 
 
 		 612 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 633 aa  352  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 592 aa  349  7e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.56 
 
 		 610 aa  345  1e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 		 607 aa  335  1e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 610 aa  333  7.000000000000001e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 609 aa  326  8.000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 		 610 aa  325  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 603 aa  324  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.61 
 
 		 610 aa  323  5e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  34.34 
 
 		 612 aa  319  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 		 610 aa  319  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 		 603 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 594 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 		 603 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 		 605 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  34.39 
 
 		 597 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 		 597 aa  299  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 602 aa  299  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 597 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 597 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 		 596 aa  298  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 637 aa  298  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 601 aa  297  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 601 aa  297  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 601 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 601 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.56 
 
 		 601 aa  296  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.28 
 
 		 602 aa  294  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  32.81 
 
 		 568 aa  293  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 605 aa  293  8e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 604 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 597 aa  291  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 598 aa  288  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 		 604 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 598 aa  288  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 		 604 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 604 aa  288  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  32.94 
 
 		 602 aa  288  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 		 601 aa  287  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 		 599 aa  287  5e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 606 aa  287  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 596 aa  286  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  31.15 
 
 		 611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 606 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 601 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 605 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 597 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 597 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 		 606 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 626 aa  283  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 597 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  32.41 
 
 		 601 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.05 
 
 		 597 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 		 601 aa  282  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 601 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  32.24 
 
 		 588 aa  281  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  33.04 
 
 		 591 aa  280  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  33.17 
 
 		 602 aa  280  6e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 		 597 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 623 aa  279  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 601 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 		 607 aa  278  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  30.57 
 
 		 587 aa  278  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 600 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 597 aa  276  7e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 		 622 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 		 580 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 630 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 598 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  33.79 
 
 		 580 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 		 600 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 616 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 601 aa  274  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 		 606 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 660 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 610 aa  270  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 606 aa  269  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.68 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 607 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 		 618 aa  269  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 593 aa  269  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 613 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 		 607 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 		 590 aa  267  4e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 660 aa  266  7e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>