17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0772 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0772  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  270  5e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000821647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1985  hypothetical protein  54.89 
 
 
135 aa  150  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0797  hypothetical protein  52.71 
 
 
134 aa  137  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.437761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2381  hypothetical protein  49.62 
 
 
133 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111754  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2947  hypothetical protein  46.88 
 
 
134 aa  119  1e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2620  hypothetical protein  42.64 
 
 
130 aa  110  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508649  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9280  hypothetical protein  43.85 
 
 
135 aa  103  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4494  hypothetical protein  31.9 
 
 
133 aa  54.3  6e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  25.78 
 
 
162 aa  51.2  5e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  26.98 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  27.52 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  26.61 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  26.61 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  22.79 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  22.63 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  26.28 
 
 
184 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0713  hypothetical protein  23.08 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>