More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0732 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  802    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  45.71 
 
 		 391 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  45.43 
 
 		 388 aa  352  7e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  47.7 
 
 		 390 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  46.47 
 
 		 399 aa  344  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  43.6 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  46.91 
 
 		 389 aa  341  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  43.58 
 
 		 388 aa  333  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  42.86 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  43.59 
 
 		 389 aa  323  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  46.03 
 
 		 396 aa  322  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  47.67 
 
 		 398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  44.56 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  41.96 
 
 		 401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  44.23 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  44.29 
 
 		 387 aa  292  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  42.15 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  40.05 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  40.22 
 
 		 407 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  40.52 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  38.59 
 
 		 395 aa  277  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  39.84 
 
 		 379 aa  275  9e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  40.76 
 
 		 379 aa  272  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  37.24 
 
 		 389 aa  272  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  38.15 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  40.16 
 
 		 376 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  38.63 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  37.5 
 
 		 391 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  35.99 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  36.58 
 
 		 389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  35.48 
 
 		 395 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  35.34 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  34.27 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 387 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  34.4 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 		 393 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  32.76 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  33.61 
 
 		 390 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  34.2 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  31.93 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  32.84 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  33.73 
 
 		 395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  32.56 
 
 		 395 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  33.43 
 
 		 406 aa  180  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  31.88 
 
 		 395 aa  173  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  30.64 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  30.68 
 
 		 392 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  30.31 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  32.56 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  30.55 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.72 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  31.02 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 		 426 aa  146  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  31.88 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  32.15 
 
 		 390 aa  143  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 		 401 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  30.57 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  29.97 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 		 391 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  30.11 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  27.18 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  28.17 
 
 		 395 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1801  extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 		 405 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 		 390 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1766  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  28.99 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3411  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  28.99 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000582907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2010  branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein, putative  28.61 
 
 		 405 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1749  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  28.87 
 
 		 405 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1931  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  28.99 
 
 		 405 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1967  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  29.57 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000097926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0700  urea ABC transporter, urea binding protein  27.65 
 
 		 463 aa  113  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172324  hitchhiker  0.0000000649369 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2031  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  28.61 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0138904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1792  branched-chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  28.99 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1931  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  28.99 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  28.76 
 
 		 390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  26.72 
 
 		 384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  28.5 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 413 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 391 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  28.23 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3805  extracellular ligand-binding receptor  26.43 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0795418  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3369  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  28.31 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  29.57 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>