More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0699 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7360  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  63.32 
 
 
691 aa  831    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0699  putative prolyl oligopeptidase  100 
 
 
688 aa  1393    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593093  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  62.13 
 
 
691 aa  791    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5937  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  57.96 
 
 
696 aa  751    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.06347 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1575  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  46.58 
 
 
689 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416  hitchhiker  0.0027772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4802  Prolyl oligopeptidase  42.9 
 
 
697 aa  550  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04132  prolyl oligopeptidase family protein  43.03 
 
 
697 aa  547  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27550  serine protease, S9A family peptidase  43.54 
 
 
684 aa  541  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143413  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3948  prolyl oligopeptidase  44.86 
 
 
702 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5550  prolyl oligopeptidase  42.92 
 
 
685 aa  538  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11141  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0623  prolyl oligopeptidase  43.67 
 
 
663 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0636  prolyl oligopeptidase  43.67 
 
 
663 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0616  prolyl oligopeptidase  43.67 
 
 
663 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3481  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.53 
 
 
698 aa  532  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.452297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0127  prolyl oligopeptidase  42.86 
 
 
681 aa  529  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268487  normal  0.664809 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10470  serine protease, S9A family peptidase  43.17 
 
 
695 aa  522  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.447718  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3695  Prolyl oligopeptidase  43.15 
 
 
711 aa  519  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0785  prolyl oligopeptidase  42 
 
 
676 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  41.04 
 
 
696 aa  518  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10464  peptidase  42.46 
 
 
673 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1717  Prolyl oligopeptidase  41.15 
 
 
711 aa  510  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0734  Prolyl oligopeptidase  42.39 
 
 
681 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2406  Prolyl oligopeptidase  40.7 
 
 
741 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0714975  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3675  Prolyl oligopeptidase  39 
 
 
676 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08100  serine protease, S9A family peptidase  39.97 
 
 
718 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.64586  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  35.25 
 
 
710 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  36.15 
 
 
697 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  36.15 
 
 
696 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  35.86 
 
 
697 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  34.96 
 
 
697 aa  438  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.06 
 
 
707 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.28 
 
 
697 aa  432  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  35.23 
 
 
697 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  33.92 
 
 
695 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4870  prolyl oligopeptidase  37.63 
 
 
722 aa  425  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  35.28 
 
 
697 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  35.28 
 
 
697 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000270623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2056  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.52 
 
 
703 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.273173  normal  0.9211 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  35.32 
 
 
701 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  35.28 
 
 
697 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46548  predicted protein  35.62 
 
 
793 aa  419  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.560157  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0527  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.23 
 
 
712 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0822  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.37 
 
 
767 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2612  Prolyl oligopeptidase  38.45 
 
 
699 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.270584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2164  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.78 
 
 
702 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.876944  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1525  prolyl oligopeptidase family protein  38.22 
 
 
694 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466095  normal  0.0843483 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5931  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  38.92 
 
 
721 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662237  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0018  prolyl oligopeptidase  36.19 
 
 
734 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2146  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.92 
 
 
721 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466085  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1125  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.74 
 
 
721 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00651092  normal  0.350875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5455  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  38.55 
 
 
704 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.29 
 
 
770 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1083  prolyl oligopeptidase family protein  36.12 
 
 
748 aa  395  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166772  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0927  prolyl oligopeptidase family protein  36.12 
 
 
732 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0454  prolyl oligopeptidase family protein  36.17 
 
 
698 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0193  prolyl oligopeptidase family protein  36.17 
 
 
772 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1911  serine protease  36.22 
 
 
776 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1414  prolyl oligopeptidase family protein  36.17 
 
 
698 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0367  prolyl oligopeptidase family protein  36.08 
 
 
782 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1824  prolyl oligopeptidase family protein  36.08 
 
 
776 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1073  Prolyl oligopeptidase  33.92 
 
 
680 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594316  decreased coverage  0.00000514493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1218  Prolyl oligopeptidase  33.97 
 
 
680 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000231766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  32.23 
 
 
719 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  34.57 
 
 
710 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  24.92 
 
 
707 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  25.85 
 
 
689 aa  174  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  37.79 
 
 
723 aa  172  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  25.79 
 
 
1283 aa  172  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  25.85 
 
 
688 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  25.85 
 
 
688 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  26.8 
 
 
701 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  25.85 
 
 
688 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  27.85 
 
 
685 aa  168  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  35.93 
 
 
690 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  38.72 
 
 
704 aa  167  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  26.36 
 
 
679 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  36.89 
 
 
666 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  42.92 
 
 
705 aa  164  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  32.72 
 
 
726 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  40.18 
 
 
714 aa  164  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  42.86 
 
 
711 aa  164  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  33.02 
 
 
719 aa  161  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  26.46 
 
 
677 aa  161  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  43.06 
 
 
697 aa  160  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  31.82 
 
 
703 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  29.76 
 
 
703 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  35.47 
 
 
690 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  28.17 
 
 
682 aa  158  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  39 
 
 
717 aa  158  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  37.94 
 
 
742 aa  157  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  35.29 
 
 
695 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  36.13 
 
 
724 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  26.72 
 
 
713 aa  156  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  36.44 
 
 
689 aa  155  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  39.26 
 
 
703 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  39.15 
 
 
708 aa  154  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  37.02 
 
 
713 aa  154  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  36.36 
 
 
692 aa  153  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  35.94 
 
 
709 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  38.24 
 
 
719 aa  151  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>