253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0627 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  41.83 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  40.32 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  40.32 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  40.32 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  40.56 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  39.64 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  37.05 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  38.4 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  38.25 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  37.88 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  38.49 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  31.3 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  34.3 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3180  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  27.42 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  28.07 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  24.38 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  29.13 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  29.03 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  30.43 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  29.2 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  25.41 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  29.94 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  29.84 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  29.17 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  25.53 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  30.95 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  29.33 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  30.21 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  24.84 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  24.27 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  26.4 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  31.14 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  24.35 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  30.65 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  34.09 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  29.89 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  34.09 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  34.09 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  26.95 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  24 
 
 		 250 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  27.11 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  24.78 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  27.13 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  32.85 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  24.78 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  24.78 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  24.78 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  29.32 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  24.73 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 		 303 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  26.77 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  24.34 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  29.48 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  31.84 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  24.78 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  27.01 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  27.18 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 		 326 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  27.89 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2721  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.91537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  24.69 
 
 		 248 aa  53.1  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>