42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0617 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  100 
 
 		 624 aa  1257    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  42.1 
 
 		 615 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1050  hypothetical protein  32.05 
 
 		 618 aa  228  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526264  normal  0.107352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4373  hypothetical protein  28.86 
 
 		 633 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.32896e-21 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  30.38 
 
 		 580 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  31.02 
 
 		 603 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  28.33 
 
 		 624 aa  197  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  27.59 
 
 		 551 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 616 aa  186  8e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  25.16 
 
 		 623 aa  173  9e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  27.69 
 
 		 593 aa  170  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4655  hypothetical protein  36.83 
 
 		 770 aa  161  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  29.66 
 
 		 659 aa  161  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3473  hypothetical protein  29.37 
 
 		 638 aa  140  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  28.51 
 
 		 651 aa  140  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  27.3 
 
 		 651 aa  134  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2381  hypothetical protein  27.97 
 
 		 584 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  28.48 
 
 		 867 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  25.59 
 
 		 673 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4347  hypothetical protein  28.3 
 
 		 675 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  24.96 
 
 		 654 aa  120  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11418  hypothetical protein  25.17 
 
 		 580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6222  hypothetical protein  27.09 
 
 		 619 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.690917  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  31.12 
 
 		 742 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0929  hypothetical protein  27.19 
 
 		 692 aa  110  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0568347  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  27.4 
 
 		 593 aa  89.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  26.45 
 
 		 644 aa  84.7  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2356  hypothetical protein  28.22 
 
 		 578 aa  61.6  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  31.28 
 
 		 582 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  32.56 
 
 		 471 aa  56.6  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  22.89 
 
 		 507 aa  53.5  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.24 
 
 		 482 aa  50.8  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  25.69 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2537  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.1 
 
 		 1072 aa  48.9  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  23.37 
 
 		 572 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  27.62 
 
 		 534 aa  45.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  27.62 
 
 		 534 aa  45.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  27.62 
 
 		 534 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  27.62 
 
 		 534 aa  45.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  27.62 
 
 		 534 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  27.62 
 
 		 534 aa  45.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>