More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0613 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0613  putative glutathione S-transferase  100 
 
 
233 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  62.33 
 
 
215 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.88 
 
 
215 aa  244  9e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173214  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5325  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.72 
 
 
214 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517428  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4867  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.05 
 
 
214 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5409  Glutathione S-transferase domain  52.11 
 
 
214 aa  211  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5352  Glutathione S-transferase domain  53.3 
 
 
214 aa  211  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  43.66 
 
 
204 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0178  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.66 
 
 
204 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  40.95 
 
 
206 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.44 
 
 
205 aa  158  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.83 
 
 
206 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0787  Glutathione S-transferase domain  42.38 
 
 
206 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2328  glutathione S-transferase  39.23 
 
 
205 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4837  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.45 
 
 
206 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2666  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.63 
 
 
217 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0074512  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0108  glutathione S-transferase-like  36.02 
 
 
204 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6303  glutathione S-transferase-like protein  42.13 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2337  glutathione S-transferase-like  42.13 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0459494  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2951  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.13 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451804  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4120  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.29 
 
 
214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2972  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.13 
 
 
212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2860  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.29 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2997  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.79 
 
 
212 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0895357  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  32.71 
 
 
201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  37.21 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2945  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.82 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  34.39 
 
 
218 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  32.23 
 
 
204 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  33.33 
 
 
198 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  34.27 
 
 
201 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  32.09 
 
 
204 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  32.24 
 
 
204 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1621  glutathionine S-transferase  34.11 
 
 
201 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  0.633635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  33.79 
 
 
217 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3101  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.3 
 
 
210 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1723  glutathionine S-transferase  34.11 
 
 
201 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00035895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1561  glutathionine S-transferase  34.11 
 
 
201 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1891  glutathionine S-transferase  34.11 
 
 
201 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0240  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.16 
 
 
206 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.21 
 
 
199 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1548  glutathionine S-transferase  34.11 
 
 
201 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23746  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1303  glutathione S-transferase  35.98 
 
 
204 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  30.37 
 
 
204 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2946  glutathione S-transferase-like  29.91 
 
 
207 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  hitchhiker  0.0000427807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  35.29 
 
 
220 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  31.48 
 
 
204 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0872  glutathione S-transferase-like  33.03 
 
 
225 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.43 
 
 
202 aa  101  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0129  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 
219 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  33.18 
 
 
206 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3859  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.43 
 
 
201 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825157  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0047  glutathione S-transferase-like  32.71 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 
201 aa  99  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01605  glutathionine S-transferase  31.78 
 
 
201 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2005  Glutathione S-transferase domain protein  31.78 
 
 
201 aa  99  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0271018  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1825  glutathionine S-transferase  31.78 
 
 
201 aa  99  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.603364  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1845  glutathionine S-transferase  31.78 
 
 
201 aa  99  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000002496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1711  glutathionine S-transferase  31.78 
 
 
201 aa  99  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0312027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2347  glutathionine S-transferase  31.78 
 
 
201 aa  99  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101767  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1994  glutathionine S-transferase  31.78 
 
 
201 aa  99  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  0.0251972 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01595  hypothetical protein  31.78 
 
 
201 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2166  putative glutathione S-transferase  31.78 
 
 
213 aa  98.6  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1298  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.21 
 
 
201 aa  98.6  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.323445  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  31.6 
 
 
201 aa  98.2  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  31.6 
 
 
201 aa  98.2  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  31.6 
 
 
201 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  32.24 
 
 
204 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  32.24 
 
 
204 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  33.18 
 
 
201 aa  95.9  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  33.18 
 
 
203 aa  95.5  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
202 aa  95.5  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0734  glutathione S-transferase-like  29.38 
 
 
204 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.148589 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 
203 aa  95.1  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  31.82 
 
 
202 aa  95.1  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3680  glutathione S-transferase  34.09 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  32.24 
 
 
202 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0048  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.84 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2659  Glutathione transferase  32.7 
 
 
202 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1740  Glutathione S-transferase domain protein  30.7 
 
 
204 aa  93.2  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.78 
 
 
202 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22380  Glutathione S-transferase protein  35.38 
 
 
206 aa  92.8  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0929  glutathione S-transferase  32.71 
 
 
206 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1115  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.02 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22530  putative glutathione S-transferase  33.49 
 
 
205 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000234667  hitchhiker  0.0000170286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2375  Glutathione S-transferase domain protein  32.7 
 
 
202 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  31.28 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  26.64 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2442  glutathione S-transferase-like protein  33.03 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666537  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  32.06 
 
 
196 aa  89.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0484  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.33 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1002  glutathione S-transferase, putative  33.18 
 
 
201 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.02 
 
 
216 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1190  Glutathione S-transferase domain  33.18 
 
 
206 aa  86.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1474  glutathione S-transferase, putative  33.18 
 
 
206 aa  86.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  31.16 
 
 
201 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1850  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.06 
 
 
209 aa  85.1  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185574 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1679  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.66 
 
 
205 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.141401  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1564  Glutathione S-transferase domain  32.57 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4683  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.73 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>