More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0610 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  234  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  234  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4906  IS66 Orf2 family protein  73.04 
 
 		 115 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  75.65 
 
 		 115 aa  182  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4816  IS66 Orf2 family protein  71.3 
 
 		 115 aa  178  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.191561 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4819  IS66 Orf2 family protein  71.3 
 
 		 115 aa  178  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.115753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1583  hypothetical protein  76.52 
 
 		 115 aa  175  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  71.05 
 
 		 116 aa  172  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3408  IS66 family transposase  71.79 
 
 		 117 aa  170  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9096  transposition-related protein  71.79 
 
 		 117 aa  170  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7044  transposase  71.79 
 
 		 117 aa  170  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0687  transposase  71.79 
 
 		 117 aa  170  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2253  IS66 Orf2 family protein  67.83 
 
 		 115 aa  163  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556164  hitchhiker  0.00787404 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5014  IS66 Orf2 family protein  67.83 
 
 		 115 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2996  IS66 Orf2 like  62.61 
 
 		 115 aa  158  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5387  IS66 Orf2 family protein  63.48 
 
 		 115 aa  156  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.936654 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5079  IS66 Orf2 family protein  61.61 
 
 		 113 aa  153  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0785  IS66 Orf2 family protein  62.5 
 
 		 113 aa  150  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3595  IS66 Orf2 family protein  61.74 
 
 		 115 aa  147  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  54.78 
 
 		 115 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  59.46 
 
 		 115 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  56.76 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0398  IS66 Orf2 like  60.95 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  58.77 
 
 		 115 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  57.89 
 
 		 115 aa  137  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  57.89 
 
 		 115 aa  137  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  57.89 
 
 		 115 aa  137  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  57.89 
 
 		 115 aa  137  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  57.89 
 
 		 115 aa  137  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  57.02 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1446  TnpB protein  57.02 
 
 		 115 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0324293  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  57.02 
 
 		 115 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  56.14 
 
 		 115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0046  IS66 family orf2  58.18 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916394  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0004  IS66 family orf2  58.18 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4880  IS66 family orf2  58.18 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0064  IS66 family orf2  58.18 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719086  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1758  IS66 family orf2  58.18 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3367  IS66 family orf2  58.18 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.555204  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0035  IS66 family element, Orf2 protein  58.18 
 
 		 115 aa  134  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4398  IS66 Orf2 family protein  55.17 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201394  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3197  IS66 Orf2 family protein  56.03 
 
 		 116 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3699  hypothetical protein  55.17 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.603868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2122  IS66 family orf2  51.82 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1338  IS66 family element, orf2  52.78 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3136  IS66 family transposase orfB  51.82 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3168  putative IS66 transposase orf2, TnpB  56.14 
 
 		 116 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589585  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1116  ISEc8 transposase  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1583  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2414  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1005  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4638  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4653  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4659  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.542564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2619  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1641  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2363  ISEc8 transposase  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000786413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4624  ISEc8 transposase  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0511  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3709  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000797988  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1002  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1114  ISEc8 transposase  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.883622  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0194  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0145  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8625  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0711  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.669363  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0708  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0018  ISEc8 transposase  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2602  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2637  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2712  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.844413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2948  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2963  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.532183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3097  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00401392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3414  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3447  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1654  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3676  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1867  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381004  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1650  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1761  IS66 family orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3385  IS66 family orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0020  IS66 family orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3344  IS66 family orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1309  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4291  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2840  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3875  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2932  IS66 family orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1813  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376504  hitchhiker  0.0000000512452 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0069  IS66 family orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0816  IS66 family orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2223  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0126387  hitchhiker  0.00000000000242445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1406  IS66 family orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0117  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.780843  normal  0.658153 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3898  IS66 family transposase orfB  51.85 
 
 		 116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4878  IS66 family orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5042  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0343  IS66 family element, orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000139365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4861  IS66 family orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0039  IS66 family orf2  54.72 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>