221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0553 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  100 
 
 		 276 aa  566  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  53.53 
 
 		 270 aa  262  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  53.53 
 
 		 275 aa  262  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  53.11 
 
 		 270 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  51.19 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  52.85 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  43.93 
 
 		 297 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  53.31 
 
 		 266 aa  245  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  49.01 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  46.62 
 
 		 266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  41.25 
 
 		 265 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  45.04 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  38.4 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  29.3 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  31.76 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  27 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  27.59 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  32.11 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  31.69 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  31.69 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  32.35 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  27.22 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  32.46 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  32.46 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  32.46 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  32.54 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 305 aa  62  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  28.71 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2345  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000431661  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  28.49 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  29.48 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  29.48 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  23.91 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1675  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  28.72 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  30.64 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  27.6 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  26.42 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  26.42 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  25.53 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  28.74 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3685  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265853  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  24.87 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  27.66 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  26.99 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  27.13 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  27.66 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  27.66 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  27.66 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  25.7 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5078  beta-lactamase domain-containing protein  26.53 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  27.66 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  29.34 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  25.28 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  25.77 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  26.38 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  26.38 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  26.38 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  26.38 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  26.95 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  25.69 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 		 317 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  28.96 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  26.38 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  24.77 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>