More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0398 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.03 
 
 		 468 aa  664    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.4 
 
 		 466 aa  679    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.24 
 
 		 467 aa  656    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.1 
 
 		 467 aa  694    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.81 
 
 		 467 aa  654    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  86.94 
 
 		 467 aa  830    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.79 
 
 		 467 aa  683    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.83 
 
 		 469 aa  664    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.16 
 
 		 468 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.12 
 
 		 467 aa  768    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 467 aa  935    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  88.87 
 
 		 467 aa  845    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.8 
 
 		 467 aa  813    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.86 
 
 		 467 aa  691    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.96 
 
 		 468 aa  646    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  88.65 
 
 		 467 aa  843    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  88.44 
 
 		 480 aa  842    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.74 
 
 		 468 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  88.22 
 
 		 467 aa  835    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.32 
 
 		 467 aa  695    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.82 
 
 		 470 aa  650    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.06 
 
 		 471 aa  659    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.4 
 
 		 466 aa  662    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.74 
 
 		 581 aa  630  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.51 
 
 		 470 aa  624  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.74 
 
 		 463 aa  627  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.67 
 
 		 468 aa  624  1e-177  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0235  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.64 
 
 		 466 aa  591  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.58 
 
 		 463 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.19 
 
 		 466 aa  577  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.81 
 
 		 466 aa  570  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.73 
 
 		 462 aa  564  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.18 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.83 
 
 		 466 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.59 
 
 		 462 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.21 
 
 		 468 aa  560  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.74 
 
 		 466 aa  551  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.73 
 
 		 462 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.01 
 
 		 463 aa  549  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.52 
 
 		 462 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.55 
 
 		 465 aa  548  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.19 
 
 		 466 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2886  dihydrolipoyl dehydrogenase  61.11 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945112  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.55 
 
 		 466 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.91 
 
 		 466 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.91 
 
 		 466 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.48 
 
 		 465 aa  529  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.55 
 
 		 466 aa  521  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  55.44 
 
 		 500 aa  521  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.57 
 
 		 462 aa  520  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.6 
 
 		 467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.1 
 
 		 462 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  56.34 
 
 		 511 aa  501  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26614  predicted protein  56.48 
 
 		 504 aa  498  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261513  normal  0.318168 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.46 
 
 		 481 aa  494  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  53.43 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.21 
 
 		 468 aa  489  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.42 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.64 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.16 
 
 		 467 aa  484  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.25 
 
 		 459 aa  483  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.51 
 
 		 474 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.53 
 
 		 460 aa  476  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  51.28 
 
 		 468 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0509  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.76 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.317708  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.13 
 
 		 479 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.06 
 
 		 470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.52 
 
 		 476 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.07 
 
 		 470 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.64 
 
 		 477 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.16 
 
 		 476 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.16 
 
 		 476 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.16 
 
 		 476 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.9 
 
 		 474 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.84 
 
 		 476 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.16 
 
 		 476 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.27 
 
 		 476 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.16 
 
 		 476 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.95 
 
 		 476 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.91 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.16 
 
 		 476 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.36 
 
 		 474 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.95 
 
 		 476 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.37 
 
 		 476 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.81 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.58 
 
 		 478 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 		 476 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.95 
 
 		 476 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.27 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.37 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.69 
 
 		 474 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.26 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2446  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 		 472 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.68 
 
 		 475 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.31 
 
 		 483 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.7 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>