More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0325 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  74.16 
 
 		 450 aa  672    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  100 
 
 		 450 aa  887    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  75 
 
 		 450 aa  673    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  76.12 
 
 		 450 aa  680    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  74.55 
 
 		 450 aa  680    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  77.18 
 
 		 450 aa  689    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  74.66 
 
 		 450 aa  667    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  54.88 
 
 		 471 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  51.94 
 
 		 448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  49.1 
 
 		 463 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  49.55 
 
 		 462 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.6 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  49.2 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  45.35 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.74 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  45.12 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  47.02 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  48.51 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  51.72 
 
 		 440 aa  359  5e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.79 
 
 		 459 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  43.52 
 
 		 456 aa  347  3e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.08 
 
 		 447 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  52.82 
 
 		 454 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.82 
 
 		 425 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.21 
 
 		 426 aa  327  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  50 
 
 		 448 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  49.22 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  47.21 
 
 		 438 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  47.7 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.76 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  44.06 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  42.12 
 
 		 419 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  39.39 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.12 
 
 		 422 aa  239  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.6 
 
 		 415 aa  238  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.94 
 
 		 422 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.17 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.3 
 
 		 535 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  36.9 
 
 		 452 aa  219  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  39.68 
 
 		 424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  32.45 
 
 		 436 aa  202  9e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  36.73 
 
 		 437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  33.92 
 
 		 436 aa  193  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  33.11 
 
 		 426 aa  192  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  31.86 
 
 		 462 aa  192  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  34.86 
 
 		 439 aa  190  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.4 
 
 		 462 aa  189  7e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  34.52 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  34.22 
 
 		 435 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  34.22 
 
 		 429 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  34.22 
 
 		 429 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  35.2 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  35.09 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  32.75 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  32.29 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6147  rRNA methyltransferase RsmB-like  37.76 
 
 		 421 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  35.35 
 
 		 429 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  35.1 
 
 		 429 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  32.89 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  35.1 
 
 		 429 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  34.9 
 
 		 448 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  28.57 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  34.6 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  34.85 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.26 
 
 		 449 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  35.93 
 
 		 464 aa  179  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  31.57 
 
 		 440 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  32.59 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  36.24 
 
 		 429 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  33.41 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  30.91 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  33.67 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  32.66 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  30.42 
 
 		 452 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  33.01 
 
 		 427 aa  176  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  31.87 
 
 		 427 aa  176  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  30.91 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  33.25 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  33.25 
 
 		 429 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  33 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  33 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  33 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3139  sun protein  36.59 
 
 		 463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  33 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0350  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.59 
 
 		 519 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  31.26 
 
 		 443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  33 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0146  sun protein  35.59 
 
 		 469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  32.53 
 
 		 427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3123  sun protein  36.59 
 
 		 463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.615938  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2509  sun protein  36.59 
 
 		 463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0165  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.59 
 
 		 469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2279  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.59 
 
 		 469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2801  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.59 
 
 		 469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  32.08 
 
 		 448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0155  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.59 
 
 		 469 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  33.74 
 
 		 427 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  26.14 
 
 		 449 aa  172  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3061  sun protein  36.92 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0205  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  29.81 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>