253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0263 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  626  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  73.68 
 
 		 360 aa  464  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  73.68 
 
 		 360 aa  464  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  69.88 
 
 		 355 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  67.08 
 
 		 354 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  66.25 
 
 		 348 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  70.47 
 
 		 352 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  63.55 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  57.59 
 
 		 339 aa  328  9e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  54.94 
 
 		 351 aa  285  7e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  37.93 
 
 		 338 aa  215  7e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  37.76 
 
 		 348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  41.5 
 
 		 343 aa  185  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  32.2 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  38.28 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  37 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  32.61 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  40.43 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  36.7 
 
 		 361 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  40 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  37.5 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  37.89 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  37.89 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  37.89 
 
 		 349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  40 
 
 		 356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  38.58 
 
 		 348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  39.12 
 
 		 361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  37.89 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  37.89 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  37.89 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  37.89 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  37.89 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  40 
 
 		 356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  37.42 
 
 		 359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  37.89 
 
 		 349 aa  173  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  40 
 
 		 356 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  32.21 
 
 		 335 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  37.69 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  31.99 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  31.99 
 
 		 340 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  36.94 
 
 		 362 aa  170  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  31.99 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  32.5 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  37.38 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  37.38 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  37.38 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  37.07 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  36.94 
 
 		 362 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  37.38 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  36.94 
 
 		 362 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  37.21 
 
 		 365 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  37.07 
 
 		 361 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  39.55 
 
 		 359 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  37.07 
 
 		 361 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  31.68 
 
 		 352 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  38.11 
 
 		 362 aa  169  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  31.99 
 
 		 352 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  38.46 
 
 		 360 aa  168  9e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  39.44 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  31.68 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  35.53 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  39.08 
 
 		 353 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  30.34 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  35 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  39.08 
 
 		 353 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  32.3 
 
 		 352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  35.64 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  32.08 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  42.65 
 
 		 360 aa  162  9e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  42.65 
 
 		 360 aa  162  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  31.37 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  38.49 
 
 		 420 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  33.33 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  37.04 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  36.73 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  37.42 
 
 		 411 aa  159  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  36.59 
 
 		 343 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2068  hypothetical protein  39.44 
 
 		 353 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  34.14 
 
 		 340 aa  158  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  32.69 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  31 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  36.03 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  36.84 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  36.3 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  36.34 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  36.76 
 
 		 355 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  38.99 
 
 		 355 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  37 
 
 		 365 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  36.2 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  40.48 
 
 		 361 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  38.49 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  33.78 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  35.47 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  34.38 
 
 		 345 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0111  hypothetical protein  29.72 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  32.66 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6400  membrane protein-like protein  36.89 
 
 		 472 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1009  hypothetical protein  37.5 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1641  hypothetical protein  37.5 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4276  hypothetical protein  37.5 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.745778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>