86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0211 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  49.58 
 
 		 263 aa  197  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1229  protein of unknown function DUF81  51.68 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2327  hypothetical protein  40.09 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1086  hypothetical protein  34.09 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1857  hypothetical protein  34.21 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251618  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  31.3 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  30.52 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  29.06 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  30.28 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  28.94 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  28.63 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  29.69 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  27.66 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  27.66 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  27.66 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  30 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  27.49 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  27.23 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  29.29 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  30.3 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  28.14 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  27.7 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  27.7 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  27.7 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0154  hypothetical protein  29.03 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.418576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  31.4 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  28.17 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  28.28 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0695  hypothetical protein  27.48 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  30.05 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  29.12 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  29.05 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  30.9 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  27.78 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0203  hypothetical protein  32.3 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  27.63 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  26.56 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  28.87 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  28.63 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  31.71 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  25.63 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  27.92 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  24.35 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  26.23 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  29.7 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  25.97 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  32.55 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  28.4 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  30.86 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  26.69 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  26.16 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  26.09 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  28.1 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  33.03 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  26.61 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  26.11 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  34.21 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  28.98 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  28 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  25.99 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  27.8 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  24.02 
 
 		 248 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  32.65 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1702  hypothetical protein  27.93 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0934945  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  26.18 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  27.08 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  28.14 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  27.16 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  31.1 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  29.03 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  26.16 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3833  protein of unknown function DUF81  25.96 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  26.61 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  20.68 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  27.63 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  24.6 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  32.35 
 
 		 245 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  31.08 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  28.85 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  32.35 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  30.43 
 
 		 244 aa  42  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  25.78 
 
 		 260 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  28.45 
 
 		 254 aa  42  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  24.68 
 
 		 247 aa  42  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>