146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0209 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 469 aa  917    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  71.95 
 
 		 476 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  68.85 
 
 		 474 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  65.01 
 
 		 480 aa  556  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  63.81 
 
 		 485 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  68.33 
 
 		 504 aa  543  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  63.73 
 
 		 476 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  44.28 
 
 		 450 aa  262  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  39.82 
 
 		 463 aa  259  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  33.08 
 
 		 425 aa  176  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  33.17 
 
 		 419 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  32.73 
 
 		 422 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  36.05 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  32.28 
 
 		 456 aa  156  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  32.64 
 
 		 414 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  32.14 
 
 		 422 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  33.1 
 
 		 442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  32.85 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  32.12 
 
 		 415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  29.75 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  31.16 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  30.36 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  32.77 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  30.89 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  33.25 
 
 		 422 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  32.34 
 
 		 422 aa  123  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  33.75 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  34.21 
 
 		 423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  31.66 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  33.75 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  32.84 
 
 		 430 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  31.85 
 
 		 424 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  29.32 
 
 		 445 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  32.66 
 
 		 417 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  32 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  27.13 
 
 		 479 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  31.36 
 
 		 457 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  25.05 
 
 		 495 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  32.1 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  24.46 
 
 		 495 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  29.67 
 
 		 427 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  28.07 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  29.05 
 
 		 466 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  27.23 
 
 		 435 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  23.02 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  26.01 
 
 		 481 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  33.17 
 
 		 439 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  30.65 
 
 		 438 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  25.17 
 
 		 628 aa  85.9  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  25.68 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  24.67 
 
 		 1199 aa  81.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  25.76 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  24.28 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  24.79 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  25.34 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  28.47 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  25.58 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  25.46 
 
 		 487 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  26.21 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  27.25 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  25.32 
 
 		 619 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  24.68 
 
 		 619 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  27.93 
 
 		 1274 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  46.67 
 
 		 492 aa  53.9  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  48.33 
 
 		 351 aa  53.9  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  25.33 
 
 		 463 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  27.1 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  29.44 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  24.55 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  24.73 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  26.18 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  43.86 
 
 		 463 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  24.89 
 
 		 578 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  37.18 
 
 		 492 aa  51.2  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  24.89 
 
 		 494 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  36.17 
 
 		 433 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  43.33 
 
 		 456 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  26.35 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  25.31 
 
 		 498 aa  50.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  25.31 
 
 		 498 aa  50.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  23.78 
 
 		 565 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  21.51 
 
 		 536 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  29.11 
 
 		 491 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  38.67 
 
 		 494 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  39.66 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  44.44 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  24.79 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  27.27 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  25 
 
 		 494 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  48.84 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  23.8 
 
 		 422 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  49.12 
 
 		 394 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  38.75 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  38.75 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  22.03 
 
 		 456 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  27.9 
 
 		 493 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  24.34 
 
 		 532 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  36.21 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  38.67 
 
 		 447 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  28.95 
 
 		 349 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>