25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0099 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0099  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  251  2e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0394  hypothetical protein  54.48 
 
 
130 aa  129  1e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0065  hypothetical protein  60.82 
 
 
115 aa  125  2e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0057  hypothetical protein  54.37 
 
 
115 aa  121  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0688215  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0195  hypothetical protein  54.81 
 
 
137 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119963  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0637  hypothetical protein  52.94 
 
 
138 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0070  hypothetical protein  50.37 
 
 
128 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0131159  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0022  hypothetical protein  37.17 
 
 
114 aa  78.6  3e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2443  hypothetical protein  36.94 
 
 
122 aa  77.8  4e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2199  hypothetical protein  51.76 
 
 
112 aa  77.4  7e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.983186  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0152  hypothetical protein  43.18 
 
 
107 aa  75.5  2e-13  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0178  hypothetical protein  41.67 
 
 
122 aa  72.8  1e-12  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0120  hypothetical protein  41.67 
 
 
122 aa  73.2  1e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.598162  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0147  hypothetical protein  42.05 
 
 
107 aa  72  2e-12  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.264223  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0411  hypothetical protein  35.65 
 
 
116 aa  72  2e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2927  hypothetical protein  44.21 
 
 
98 aa  72  3e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.142227  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2218  hypothetical protein  52.11 
 
 
106 aa  71.2  4e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102772  normal  0.371224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0058  hypothetical protein  40.48 
 
 
110 aa  71.2  5e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772862  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0164  hypothetical protein  39.77 
 
 
107 aa  70.1  1e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2502  hypothetical protein  40 
 
 
112 aa  69.3  2e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.246451  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0042  hypothetical protein  38.1 
 
 
110 aa  69.3  2e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0203  hypothetical protein  39.58 
 
 
122 aa  68.6  3e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0146  hypothetical protein  31.76 
 
 
95 aa  59.7  1e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3673  hypothetical protein  39.13 
 
 
107 aa  57.4  6e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0145  hypothetical protein  37.14 
 
 
108 aa  48.9  2e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>