More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0094 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  100 
 
 
447 aa  894  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  72.42 
 
 
447 aa  611  1e-174  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  70.5 
 
 
442 aa  612  1e-174  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  70.65 
 
 
442 aa  612  1e-174  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  68.62 
 
 
448 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  69.16 
 
 
448 aa  605  1e-172  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  68.9 
 
 
442 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  59.28 
 
 
447 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  4.1019e-06 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  56.04 
 
 
441 aa  470  1e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  55.73 
 
 
438 aa  453  1e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  53.33 
 
 
438 aa  450  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  55.13 
 
 
441 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  55.13 
 
 
441 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  56.49 
 
 
441 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  55.48 
 
 
441 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  54.11 
 
 
441 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  49.77 
 
 
442 aa  406  1e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  49.54 
 
 
442 aa  405  1e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  50.12 
 
 
430 aa  401  1e-110  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  48.72 
 
 
421 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  50.23 
 
 
470 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  49.65 
 
 
423 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  49.77 
 
 
440 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  50.11 
 
 
447 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  48.74 
 
 
442 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  48.74 
 
 
442 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  50 
 
 
422 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  49.2 
 
 
444 aa  354  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  51.97 
 
 
437 aa  353  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  49.88 
 
 
412 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  48.85 
 
 
424 aa  342  9e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  51.72 
 
 
422 aa  340  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  48.28 
 
 
432 aa  338  1e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  45.19 
 
 
453 aa  338  1e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  48.08 
 
 
435 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  48.62 
 
 
424 aa  330  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  45 
 
 
467 aa  327  2e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  48.5 
 
 
437 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  41.14 
 
 
440 aa  320  3e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  45.27 
 
 
397 aa  316  5e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  37.47 
 
 
429 aa  300  4e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  42.76 
 
 
443 aa  286  5e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  38.11 
 
 
434 aa  281  1e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  41.76 
 
 
435 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  38.11 
 
 
435 aa  274  2e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  36.21 
 
 
442 aa  238  2e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  36.07 
 
 
426 aa  223  5e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  34.34 
 
 
457 aa  216  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.37038e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  35.06 
 
 
424 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  37.92 
 
 
422 aa  206  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  32.95 
 
 
428 aa  206  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  36.55 
 
 
425 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  33.56 
 
 
425 aa  201  2e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  35.24 
 
 
427 aa  199  1e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.67 
 
 
431 aa  198  2e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  31.35 
 
 
418 aa  197  2e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  34.11 
 
 
424 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  35.57 
 
 
424 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  31.12 
 
 
418 aa  197  5e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  31.89 
 
 
429 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  32.54 
 
 
432 aa  193  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  34.92 
 
 
437 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  38.2 
 
 
442 aa  191  3e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35 
 
 
427 aa  190  5e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  31.46 
 
 
420 aa  189  6e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  40.31 
 
 
431 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  35.19 
 
 
447 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  34.08 
 
 
443 aa  189  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  35.73 
 
 
428 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  33.87 
 
 
422 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  36.13 
 
 
424 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  33.95 
 
 
429 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.53 
 
 
466 aa  187  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  35.43 
 
 
424 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  39.63 
 
 
431 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  35.25 
 
 
440 aa  185  1e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
435 aa  184  2e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  32.79 
 
 
434 aa  184  4e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  3.74021e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
412 aa  183  5e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.02 
 
 
433 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  31.95 
 
 
437 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  40.25 
 
 
386 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  31.25 
 
 
424 aa  181  3e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  37.61 
 
 
403 aa  181  3e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  31.74 
 
 
433 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  31.69 
 
 
433 aa  179  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  31.57 
 
 
416 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  31.79 
 
 
433 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  32.08 
 
 
433 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0322  FolC bifunctional protein  32.48 
 
 
411 aa  178  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  32.08 
 
 
433 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  32.08 
 
 
433 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  31.36 
 
 
438 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  34.94 
 
 
439 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  32.58 
 
 
433 aa  177  5e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  31.55 
 
 
433 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  33.03 
 
 
459 aa  176  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 
430 aa  176  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  32.59 
 
 
434 aa  175  1e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  33.58 
 
 
465 aa  175  1e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>