More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0091 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  100 
 
 
106 aa  213  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  93.4 
 
 
106 aa  202  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  92.45 
 
 
106 aa  201  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  93.4 
 
 
106 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  88.68 
 
 
106 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  85.85 
 
 
106 aa  193  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  84.91 
 
 
106 aa  190  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  70.75 
 
 
106 aa  168  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  62.75 
 
 
104 aa  150  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  65.71 
 
 
107 aa  147  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  65.71 
 
 
106 aa  145  1e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  65.38 
 
 
107 aa  145  1e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  63.21 
 
 
107 aa  145  1e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  64.76 
 
 
119 aa  145  1e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  64.76 
 
 
106 aa  145  2e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  64.15 
 
 
107 aa  145  2e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  60 
 
 
107 aa  144  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  59.43 
 
 
106 aa  143  7e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  63.81 
 
 
106 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  59.05 
 
 
107 aa  141  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  59.05 
 
 
107 aa  141  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  61.32 
 
 
107 aa  139  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  56.19 
 
 
111 aa  139  2e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  61.9 
 
 
106 aa  139  2e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  56.6 
 
 
106 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  59.62 
 
 
107 aa  138  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  61.9 
 
 
106 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  57.43 
 
 
108 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  56.86 
 
 
108 aa  134  6e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  54.9 
 
 
108 aa  133  7e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  59.41 
 
 
148 aa  132  1e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  61.22 
 
 
107 aa  132  2e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  54.29 
 
 
108 aa  132  2e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  56.86 
 
 
107 aa  132  2e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  62.37 
 
 
108 aa  132  2e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  59.43 
 
 
106 aa  131  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  59.38 
 
 
125 aa  131  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  58.76 
 
 
107 aa  131  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  57.55 
 
 
106 aa  131  4e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  57.55 
 
 
106 aa  131  4e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  53.77 
 
 
106 aa  131  4e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  57.55 
 
 
106 aa  130  4e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  60.2 
 
 
107 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  60.2 
 
 
107 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  52.94 
 
 
107 aa  129  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  57.43 
 
 
107 aa  129  1e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  2.65159e-07 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  58.16 
 
 
107 aa  129  1e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  55.66 
 
 
104 aa  129  1e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.56705e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  59.18 
 
 
124 aa  129  1e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  58.76 
 
 
108 aa  128  2e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  6.55412e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  56.44 
 
 
108 aa  128  2e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  56.57 
 
 
107 aa  129  2e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  55.24 
 
 
107 aa  129  2e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  59.18 
 
 
107 aa  128  2e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  60 
 
 
109 aa  128  2e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  54.81 
 
 
108 aa  129  2e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  51.96 
 
 
108 aa  128  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  63.73 
 
 
107 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  50.98 
 
 
108 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  50 
 
 
110 aa  128  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  55.66 
 
 
106 aa  128  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  52.88 
 
 
108 aa  127  5e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  58.51 
 
 
107 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  56.12 
 
 
107 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  56.86 
 
 
106 aa  127  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  56.12 
 
 
107 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  58.51 
 
 
107 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  56.12 
 
 
107 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  50.94 
 
 
106 aa  127  7e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  127  7e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  53.85 
 
 
108 aa  126  8e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  53.92 
 
 
108 aa  126  8e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  49.06 
 
 
106 aa  126  8e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  54.46 
 
 
107 aa  126  9e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  52.53 
 
 
106 aa  125  1e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  126  1e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  52.88 
 
 
109 aa  125  1e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  50.98 
 
 
108 aa  126  1e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  53.77 
 
 
106 aa  125  1e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  58.51 
 
 
107 aa  125  1e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  50.96 
 
 
108 aa  125  2e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  50.96 
 
 
108 aa  125  2e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  50.96 
 
 
108 aa  125  2e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  125  2e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  55.1 
 
 
109 aa  125  2e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  125  2e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  125  2e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  50.96 
 
 
108 aa  125  2e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  52.83 
 
 
106 aa  125  2e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  54.81 
 
 
108 aa  125  2e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  50.96 
 
 
108 aa  125  2e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  59.14 
 
 
109 aa  125  2e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  50.96 
 
 
108 aa  125  2e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  58.06 
 
 
107 aa  125  2e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  50.96 
 
 
112 aa  124  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.65425e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  53.47 
 
 
108 aa  124  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  58.06 
 
 
123 aa  124  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>