More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0086 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  100 
 
 
509 aa  1018  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  66.86 
 
 
507 aa  670  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  68.38 
 
 
506 aa  681  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  68.71 
 
 
505 aa  681  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  67.72 
 
 
507 aa  667  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  67 
 
 
505 aa  664  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  69.31 
 
 
506 aa  680  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  51.9 
 
 
523 aa  491  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  49.8 
 
 
540 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  49.7 
 
 
549 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  47.7 
 
 
523 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  49.8 
 
 
542 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  48.52 
 
 
529 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  50.1 
 
 
529 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  48.13 
 
 
514 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  45.31 
 
 
503 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  45.25 
 
 
504 aa  406  1e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  47.05 
 
 
562 aa  401  1e-110  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  43.34 
 
 
505 aa  399  1e-110  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  42.02 
 
 
497 aa  386  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  44.6 
 
 
513 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  44.4 
 
 
513 aa  385  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  43.84 
 
 
509 aa  382  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  45 
 
 
502 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  47.03 
 
 
498 aa  352  8e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0135  aminoglycoside phosphotransferase  42.98 
 
 
362 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  36.95 
 
 
472 aa  230  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4850  aminoglycoside phosphotransferase  40.45 
 
 
363 aa  214  3e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191997  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  38.21 
 
 
358 aa  197  5e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  37.61 
 
 
332 aa  191  3e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  38.79 
 
 
323 aa  184  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  38.04 
 
 
360 aa  184  4e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2954  aminoglycoside phosphotransferase  39 
 
 
342 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290607  normal  0.0281748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  38.19 
 
 
328 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0083  aminoglycoside phosphotransferase  34.17 
 
 
365 aa  170  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.972168 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0175  aminoglycoside phosphotransferase  38.15 
 
 
341 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00583599  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1523  hypothetical protein  37.75 
 
 
341 aa  167  3e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  34.47 
 
 
328 aa  164  4e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  34.2 
 
 
327 aa  159  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3435  aminoglycoside phosphotransferase  34.86 
 
 
332 aa  151  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  35.17 
 
 
340 aa  142  1e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4063  aminoglycoside phosphotransferase  34.42 
 
 
308 aa  140  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  33.97 
 
 
362 aa  135  1e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  33.02 
 
 
338 aa  136  1e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  33.33 
 
 
338 aa  135  2e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  36.3 
 
 
346 aa  134  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  34.08 
 
 
330 aa  131  2e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  36.5 
 
 
372 aa  130  4e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  33.44 
 
 
340 aa  130  5e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  32.49 
 
 
336 aa  130  7e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  30.48 
 
 
365 aa  129  1e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  35.65 
 
 
341 aa  129  1e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  34.85 
 
 
323 aa  129  2e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  33.54 
 
 
341 aa  129  2e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  30.61 
 
 
345 aa  128  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  33.21 
 
 
333 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  32.69 
 
 
339 aa  126  8e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  26.91 
 
 
312 aa  126  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  30.19 
 
 
329 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  32.91 
 
 
340 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  31.73 
 
 
339 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  32.69 
 
 
344 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  32.81 
 
 
350 aa  124  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  31.8 
 
 
341 aa  124  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  29.94 
 
 
356 aa  123  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  32.04 
 
 
348 aa  122  1e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  30.95 
 
 
344 aa  121  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  30.94 
 
 
341 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  30.79 
 
 
384 aa  121  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  7.33825e-05 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  31.89 
 
 
427 aa  121  4e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5276  aminoglycoside phosphotransferase  32.3 
 
 
391 aa  120  5e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  30.99 
 
 
338 aa  120  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.0357e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  31.82 
 
 
339 aa  120  8e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  31.19 
 
 
339 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  29.33 
 
 
379 aa  119  1e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  32.87 
 
 
346 aa  119  2e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  29.77 
 
 
325 aa  118  2e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  29.77 
 
 
325 aa  119  2e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  32.09 
 
 
387 aa  118  2e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  31.19 
 
 
339 aa  119  2e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  32.46 
 
 
352 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 
393 aa  117  4e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  32.19 
 
 
357 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  31.78 
 
 
387 aa  116  1e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  29.91 
 
 
347 aa  116  1e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  30.79 
 
 
379 aa  116  1e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  32.19 
 
 
357 aa  115  2e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  28.99 
 
 
331 aa  115  2e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  27.45 
 
 
334 aa  114  4e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0866  aminoglycoside phosphotransferase  26.87 
 
 
348 aa  114  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000878468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  29.88 
 
 
361 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3205  aminoglycoside phosphotransferase  29.94 
 
 
363 aa  112  1e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00746028  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  30.27 
 
 
340 aa  113  1e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  30.35 
 
 
341 aa  112  2e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  29.88 
 
 
361 aa  112  2e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  31.61 
 
 
360 aa  110  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0909  aminoglycoside phosphotransferase  29.34 
 
 
363 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179002  normal  0.193933 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  29.03 
 
 
351 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  28.99 
 
 
361 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4864  aminoglycoside phosphotransferase  29.7 
 
 
388 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.430535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>