294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0077 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  543  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  62.09 
 
 
250 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  53.36 
 
 
249 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.5 
 
 
229 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.5 
 
 
229 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.55 
 
 
229 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.09 
 
 
215 aa  164  1e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.72 
 
 
240 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.32 
 
 
220 aa  116  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.54 
 
 
226 aa  115  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.89 
 
 
232 aa  115  1e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.59 
 
 
226 aa  111  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.05 
 
 
226 aa  110  2e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.58 
 
 
226 aa  110  2e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.09 
 
 
224 aa  110  2e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  35.81 
 
 
225 aa  110  2e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.59 
 
 
216 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.86 
 
 
214 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.93 
 
 
215 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  35.21 
 
 
240 aa  105  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.12 
 
 
216 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.58 
 
 
226 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 
234 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.82 
 
 
215 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.21 
 
 
241 aa  99  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.85 
 
 
216 aa  99  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  32.54 
 
 
309 aa  96.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.94 
 
 
211 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  32.56 
 
 
221 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.21 
 
 
219 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.48 
 
 
217 aa  87  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.43 
 
 
212 aa  85.5  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  31.28 
 
 
223 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.7 
 
 
223 aa  83.6  3e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.04 
 
 
217 aa  80.9  2e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.23 
 
 
209 aa  80.1  4e-14  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  33.5 
 
 
211 aa  77  3e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  31.71 
 
 
207 aa  75.9  6e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2122  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  34.19 
 
 
199 aa  72.8  6e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617804  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.56 
 
 
211 aa  72.4  6e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.56 
 
 
211 aa  72.4  6e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.95 
 
 
221 aa  72  9e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.1 
 
 
222 aa  71.2  2e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.61 
 
 
214 aa  71.2  2e-11  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35 
 
 
217 aa  68.6  9e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  28.29 
 
 
217 aa  67  3e-10  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  27.67 
 
 
217 aa  67  3e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.13 
 
 
217 aa  65.9  7e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.05 
 
 
207 aa  65.5  8e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 
213 aa  64.7  1e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  30.81 
 
 
203 aa  64.7  1e-09  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1239  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.99 
 
 
205 aa  64.3  2e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.67 
 
 
217 aa  64.3  2e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.62 
 
 
212 aa  64.7  2e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  32.24 
 
 
210 aa  63.5  3e-09  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.75 
 
 
211 aa  63.2  4e-09  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.96 
 
 
209 aa  62.8  6e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.02 
 
 
217 aa  62.8  6e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  30.32 
 
 
227 aa  62.4  8e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.1 
 
 
217 aa  61.6  1e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.88 
 
 
206 aa  61.6  1e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.72 
 
 
219 aa  61.6  1e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  29.13 
 
 
206 aa  61.6  1e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  28.04 
 
 
210 aa  61.2  2e-08  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.76 
 
 
212 aa  61.2  2e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.56 
 
 
217 aa  61.2  2e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  31.86 
 
 
213 aa  61.2  2e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  31.86 
 
 
213 aa  61.2  2e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  29.36 
 
 
206 aa  61.2  2e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  28.64 
 
 
209 aa  60.5  3e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  22.22 
 
 
222 aa  60.5  3e-08  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.14 
 
 
217 aa  60.1  4e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.14 
 
 
217 aa  60.1  4e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.86 
 
 
205 aa  59.7  4e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.24 
 
 
212 aa  60.1  4e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  29.46 
 
 
209 aa  60.1  4e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3754  hypothetical protein  31.29 
 
 
214 aa  59.7  5e-08  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29 
 
 
209 aa  59.3  6e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.15 
 
 
217 aa  59.3  6e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  28.86 
 
 
201 aa  58.9  7e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 
212 aa  59.3  7e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 
234 aa  58.9  8e-08  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  29.36 
 
 
213 aa  58.9  8e-08  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  4.2547e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36 
 
 
219 aa  58.2  1e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.68 
 
 
206 aa  58.2  1e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  6.18537e-08 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.43 
 
 
212 aa  58.5  1e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 
232 aa  57.8  2e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.67 
 
 
212 aa  57.4  2e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.67 
 
 
212 aa  57.8  2e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 
232 aa  57.8  2e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  35.2 
 
 
212 aa  57.4  3e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.33 
 
 
220 aa  57.4  3e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
212 aa  57  3e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.53 
 
 
212 aa  57  3e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36 
 
 
222 aa  57  3e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  32.43 
 
 
212 aa  57  3e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.39072e-11  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.08 
 
 
212 aa  57  3e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.71 
 
 
219 aa  56.6  4e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.55 
 
 
231 aa  56.6  4e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.55 
 
 
231 aa  56.6  4e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>