57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0072 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  282  1e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  83.21 
 
 
175 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  80.29 
 
 
185 aa  243  6e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  78.83 
 
 
174 aa  240  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  79.56 
 
 
174 aa  239  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  78.83 
 
 
176 aa  238  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  79.56 
 
 
174 aa  238  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  58.39 
 
 
192 aa  182  1e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  64.71 
 
 
177 aa  182  1e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  53.68 
 
 
183 aa  170  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  54.86 
 
 
187 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  54.86 
 
 
194 aa  160  5e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  53.29 
 
 
197 aa  154  5e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  53.29 
 
 
197 aa  154  5e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  51.97 
 
 
197 aa  150  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  52.05 
 
 
187 aa  151  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  47.45 
 
 
245 aa  143  7e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  47.45 
 
 
181 aa  143  8e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  47.83 
 
 
190 aa  139  1e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  44.93 
 
 
199 aa  137  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.44722e-08 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  45 
 
 
185 aa  136  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  45.71 
 
 
179 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  46.38 
 
 
179 aa  134  3e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  45.71 
 
 
179 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  45.52 
 
 
203 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  43.48 
 
 
183 aa  130  4e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  45.52 
 
 
191 aa  130  4e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  44.03 
 
 
200 aa  129  1e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  39.13 
 
 
185 aa  129  2e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  44.62 
 
 
204 aa  127  4e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  45.52 
 
 
188 aa  127  5e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  44.78 
 
 
197 aa  126  8e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  44.03 
 
 
200 aa  122  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0914  hypothetical protein  38.81 
 
 
190 aa  120  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  43.26 
 
 
239 aa  119  1e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  40.29 
 
 
186 aa  119  1e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  43.88 
 
 
184 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  37.23 
 
 
182 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  42.24 
 
 
113 aa  100  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  35.97 
 
 
177 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4584  hypothetical protein  35.04 
 
 
160 aa  93.6  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2307  hypothetical protein  32.56 
 
 
173 aa  87  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  31.5 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2000  protein of unknown function DUF1058  48.57 
 
 
367 aa  78.2  4e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  34.75 
 
 
165 aa  59.7  1e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  31.25 
 
 
162 aa  58.5  3e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  28.8 
 
 
149 aa  57  8e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  29.92 
 
 
158 aa  55.5  2e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  30.71 
 
 
158 aa  55.8  2e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  30.71 
 
 
158 aa  55.8  2e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2403  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  55.1  3e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.482031  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  28.57 
 
 
153 aa  51.6  4e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  35.35 
 
 
149 aa  50.8  6e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  31 
 
 
141 aa  50.1  1e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  32.08 
 
 
245 aa  47.4  8e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  27.14 
 
 
424 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.25506e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  26.12 
 
 
582 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.66692e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>