50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0063 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0063  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  321  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800795  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2745  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
149 aa  71.6  4e-12  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6940  putative acetyltransferase  32.69 
 
 
149 aa  67.8  6e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
153 aa  60.1  1e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4339  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
147 aa  58.5  4e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0386238  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0845  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 
159 aa  55.8  2e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.455582  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2371  GCN5-related N-acetyltransferase  32.33 
 
 
161 aa  55.5  3e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4489  GCN5-related N-acetyltransferase  27.48 
 
 
166 aa  52.4  2e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.410319  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3147  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 
155 aa  52.8  2e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.757532  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1700  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
170 aa  51.2  5e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114445  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3235  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
162 aa  50.8  8e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00983656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
164 aa  50.4  8e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1553  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
171 aa  48.9  2e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0158841  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2481  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
163 aa  48.9  3e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  8.27608e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0799  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
148 aa  48.5  3e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1998  acetyltransferase (GNAT) family protein  26.21 
 
 
140 aa  48.9  3e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0762765  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1576  GCN5-related N-acetyltransferase  26.75 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
151 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  35.35 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1096  GCN5-related N-acetyltransferase  26.75 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517524  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  46.55 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187348  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12788  hypothetical protein  29.58 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535784  normal  0.528697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1223  GCN5-related N-acetyltransferase  26.53 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1492  GCN5-related N-acetyltransferase  28.39 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1192  acetyltransferase  26.53 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.261009  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
237 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609857  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1472  GCN5-related N-acetyltransferase  27.39 
 
 
172 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2137  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
167 aa  43.9  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4266  GCN5-related N-acetyltransferase  25.35 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0801  hypothetical protein  41.51 
 
 
211 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4688  GCN5-related N-acetyltransferase  25.9 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0592  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0198  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3135  GCN5-related N-acetyltransferase  26.58 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707341  decreased coverage  0.000155251 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2792  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  6.22629e-05 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225565 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2214  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0180  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1732  GCN5-related N-acetyltransferase  29.56 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0991  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.84 
 
 
150 aa  41.6  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0274305  hitchhiker  5.84057e-09 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42420  acetylating ribosomal protein, RimI  33.78 
 
 
141 aa  41.2  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195178  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0839  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
165 aa  40.8  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.020664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.57 
 
 
151 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.291315  normal  0.765144 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0612  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.67 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0611  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 
180 aa  40.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1001  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.84 
 
 
170 aa  40.4  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.491632  hitchhiker  0.0014892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
188 aa  40.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>