More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0054 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  70.27 
 
 
263 aa  356  2e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  71.65 
 
 
259 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  70.82 
 
 
262 aa  350  9e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  70.31 
 
 
260 aa  333  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  69.41 
 
 
259 aa  326  2e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  67.83 
 
 
272 aa  319  2e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  58.85 
 
 
201 aa  216  3e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  61.24 
 
 
286 aa  214  1e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  60.57 
 
 
238 aa  212  5e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  56.82 
 
 
220 aa  205  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  53.63 
 
 
201 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  57.49 
 
 
205 aa  201  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  57.87 
 
 
255 aa  200  2e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  52.84 
 
 
201 aa  200  2e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  57.87 
 
 
251 aa  198  8e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  57.87 
 
 
251 aa  198  8e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  53.76 
 
 
314 aa  197  1e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  49.27 
 
 
219 aa  194  8e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  49.27 
 
 
219 aa  194  8e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  57.06 
 
 
257 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  52 
 
 
224 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  56.07 
 
 
279 aa  192  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  50.88 
 
 
204 aa  189  3e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  46.63 
 
 
209 aa  169  5e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  45.09 
 
 
204 aa  151  9e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  43.93 
 
 
204 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  45.9 
 
 
207 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  43.35 
 
 
204 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  41.81 
 
 
206 aa  146  2e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  43.35 
 
 
203 aa  145  7e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  45.05 
 
 
207 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  39.88 
 
 
194 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  39.88 
 
 
196 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  46.79 
 
 
199 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  44.1 
 
 
225 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  45.03 
 
 
186 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  43.37 
 
 
178 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  44.38 
 
 
201 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  45.06 
 
 
181 aa  115  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  42.68 
 
 
186 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  40.27 
 
 
176 aa  112  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  41.53 
 
 
151 aa  105  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  35.29 
 
 
151 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.28557e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  35.95 
 
 
159 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  39.47 
 
 
153 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  35.57 
 
 
152 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  35.57 
 
 
152 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  37.32 
 
 
152 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  36.11 
 
 
150 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  36.11 
 
 
150 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.74705e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  36.11 
 
 
150 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.06744e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  35.97 
 
 
140 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  35.25 
 
 
150 aa  93.2  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  35.25 
 
 
150 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  35.25 
 
 
150 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  9.77256e-05 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  35.25 
 
 
150 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  32.03 
 
 
151 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  35.04 
 
 
151 aa  93.6  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.37373e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  35.25 
 
 
150 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  35.25 
 
 
150 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  35.25 
 
 
154 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  35.25 
 
 
154 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  34.53 
 
 
150 aa  92.8  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  35.25 
 
 
140 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  37.8 
 
 
153 aa  92  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  38.6 
 
 
169 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  35.97 
 
 
150 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  38.6 
 
 
152 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  34.62 
 
 
161 aa  92  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  3.15608e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  35.97 
 
 
150 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  35.97 
 
 
150 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  35.42 
 
 
154 aa  91.7  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  35.33 
 
 
156 aa  91.3  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  8.54014e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  35.97 
 
 
154 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  35.97 
 
 
154 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  34.3 
 
 
191 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  36.5 
 
 
140 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  39.13 
 
 
152 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  37.72 
 
 
169 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  37.72 
 
 
169 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  33.99 
 
 
158 aa  89  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.08313e-08  unclonable  8.57031e-09 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  41.54 
 
 
159 aa  89  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  31.17 
 
 
151 aa  89  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  38.16 
 
 
171 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  36.84 
 
 
166 aa  88.6  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  36.77 
 
 
159 aa  88.6  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  5.81162e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  33.09 
 
 
150 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  33.87 
 
 
153 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  34.35 
 
 
196 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  34.4 
 
 
154 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.84773e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  38.16 
 
 
171 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  37.5 
 
 
171 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  36.36 
 
 
171 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  38.3 
 
 
153 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  38.3 
 
 
150 aa  86.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  35.94 
 
 
152 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.26023e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  39.81 
 
 
176 aa  85.9  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  33.77 
 
 
151 aa  85.1  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.20853e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  35.33 
 
 
151 aa  85.1  1e-15  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>