More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0050 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  68.53 
 
 
536 aa  721  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
536 aa  1064  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  66.42 
 
 
536 aa  707  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  71.46 
 
 
534 aa  749  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  70.53 
 
 
535 aa  745  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  72.47 
 
 
541 aa  764  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  68.5 
 
 
536 aa  723  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  53.2 
 
 
540 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  50.28 
 
 
556 aa  435  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  50.28 
 
 
567 aa  425  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  50.46 
 
 
567 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  47.44 
 
 
543 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  50 
 
 
553 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  45.56 
 
 
550 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  44.36 
 
 
532 aa  406  1e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  49.73 
 
 
566 aa  405  1e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  46.36 
 
 
534 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  47.34 
 
 
576 aa  405  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  44.81 
 
 
557 aa  405  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  45.55 
 
 
534 aa  399  1e-110  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  43.29 
 
 
532 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  43.1 
 
 
532 aa  396  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  42.91 
 
 
543 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  4.81156e-12 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  41.68 
 
 
528 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  41.44 
 
 
541 aa  369  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  40.55 
 
 
523 aa  304  2e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  40.55 
 
 
523 aa  304  2e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  38.05 
 
 
537 aa  300  4e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  37.53 
 
 
531 aa  282  9e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  36.85 
 
 
528 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  35.81 
 
 
502 aa  260  5e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  39.06 
 
 
495 aa  256  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  33.26 
 
 
488 aa  256  1e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  39.13 
 
 
508 aa  255  2e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  38.51 
 
 
495 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  39.31 
 
 
495 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  37.48 
 
 
487 aa  246  8e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  31.7 
 
 
501 aa  244  4e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  36.06 
 
 
497 aa  240  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  31.76 
 
 
472 aa  232  1e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  35.21 
 
 
525 aa  229  7e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  35.06 
 
 
522 aa  214  3e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  33.21 
 
 
588 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  32.48 
 
 
510 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  31.14 
 
 
521 aa  200  4e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  31.35 
 
 
573 aa  199  1e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  33.82 
 
 
507 aa  197  5e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  34 
 
 
506 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  32.83 
 
 
509 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  33.13 
 
 
507 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0020  apolipoprotein N-acyltransferase  35.42 
 
 
509 aa  189  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  30.6 
 
 
521 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  32.76 
 
 
513 aa  188  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  32.13 
 
 
516 aa  187  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  33.26 
 
 
477 aa  185  2e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  28.4 
 
 
524 aa  184  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  30.75 
 
 
518 aa  184  4e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  29.2 
 
 
523 aa  183  7e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  31.42 
 
 
537 aa  183  8e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  31.11 
 
 
507 aa  181  3e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  31.8 
 
 
506 aa  180  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  27.74 
 
 
524 aa  179  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  30.89 
 
 
509 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  32.46 
 
 
509 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  30.11 
 
 
512 aa  177  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  31.74 
 
 
516 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 
525 aa  176  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  30.15 
 
 
514 aa  174  3e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  31.4 
 
 
515 aa  174  3e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  31.4 
 
 
515 aa  174  3e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  31.4 
 
 
515 aa  174  3e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  31.86 
 
 
515 aa  174  4e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  2.54581e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  29.68 
 
 
529 aa  174  4e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  29.68 
 
 
529 aa  174  4e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  30.48 
 
 
542 aa  174  4e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  31.25 
 
 
526 aa  173  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  29.68 
 
 
529 aa  173  6e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  29.68 
 
 
529 aa  173  6e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  29.68 
 
 
529 aa  173  6e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1102  apolipoprotein N-acyltransferase  30.2 
 
 
524 aa  173  8e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49878e-09 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  27.78 
 
 
522 aa  173  9e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  31.55 
 
 
516 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2210  apolipoprotein N-acyltransferase  30.53 
 
 
497 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  30.75 
 
 
519 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  31.15 
 
 
506 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  30.7 
 
 
503 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  32.07 
 
 
532 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  8.38838e-07  hitchhiker  2.62387e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  32.86 
 
 
505 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  32.86 
 
 
505 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  27.58 
 
 
510 aa  171  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  30.2 
 
 
511 aa  170  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  29.29 
 
 
553 aa  170  5e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  35.79 
 
 
524 aa  170  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  30.09 
 
 
524 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  29.91 
 
 
524 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  30.06 
 
 
503 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  30.13 
 
 
511 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  28.41 
 
 
501 aa  167  3e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  31.69 
 
 
523 aa  167  3e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3307  apolipoprotein N-acyltransferase  30.09 
 
 
524 aa  167  3e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>