More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0048 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  342  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  72.62 
 
 
190 aa  254  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  73.01 
 
 
190 aa  251  4e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  67.84 
 
 
195 aa  235  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  73.62 
 
 
168 aa  231  2e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  66.67 
 
 
195 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  66.27 
 
 
167 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  53.95 
 
 
158 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  53.95 
 
 
158 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  52.23 
 
 
162 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  57.42 
 
 
176 aa  147  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  57.89 
 
 
168 aa  146  2e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  7.41924e-09 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  51.23 
 
 
167 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  62.07 
 
 
171 aa  137  8e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  50 
 
 
161 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  50.34 
 
 
161 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  50.34 
 
 
161 aa  134  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  52.05 
 
 
159 aa  133  1e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  60.34 
 
 
171 aa  131  4e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  42.18 
 
 
158 aa  129  2e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  51.52 
 
 
163 aa  129  2e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  49.38 
 
 
176 aa  129  2e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  52.38 
 
 
147 aa  128  5e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  53.66 
 
 
168 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  47.13 
 
 
159 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  43.56 
 
 
162 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  44.57 
 
 
200 aa  120  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  51.64 
 
 
154 aa  120  1e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  43.4 
 
 
160 aa  119  1e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  50.32 
 
 
159 aa  119  2e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  52.94 
 
 
162 aa  117  8e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  48.55 
 
 
161 aa  117  1e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  5.94068e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  49.17 
 
 
158 aa  117  1e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  45.06 
 
 
185 aa  117  1e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  51.69 
 
 
157 aa  115  2e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  57.63 
 
 
205 aa  115  2e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  49.57 
 
 
159 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  50.83 
 
 
154 aa  115  4e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  42.59 
 
 
174 aa  114  7e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  50.83 
 
 
167 aa  114  8e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  50 
 
 
157 aa  113  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  48.72 
 
 
159 aa  113  1e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  50 
 
 
157 aa  113  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  50 
 
 
157 aa  113  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  50 
 
 
157 aa  113  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  49.18 
 
 
154 aa  113  2e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  51.94 
 
 
167 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  41.76 
 
 
181 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  45.53 
 
 
158 aa  111  4e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  49.15 
 
 
157 aa  111  4e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  46.45 
 
 
169 aa  111  4e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  51.67 
 
 
168 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  49.58 
 
 
154 aa  111  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  46.92 
 
 
154 aa  110  8e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0190  hypothetical protein  42.5 
 
 
194 aa  110  1e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  42.42 
 
 
155 aa  110  1e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  48.36 
 
 
154 aa  110  1e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  52.1 
 
 
160 aa  109  2e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  48 
 
 
161 aa  109  2e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  45.45 
 
 
157 aa  109  2e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  46.67 
 
 
154 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  46.22 
 
 
153 aa  108  4e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  42.74 
 
 
152 aa  107  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  45.99 
 
 
137 aa  108  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3035  hypothetical protein  39.35 
 
 
160 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  43.9 
 
 
158 aa  108  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  43.59 
 
 
171 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  43.9 
 
 
156 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  47.54 
 
 
161 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  44.72 
 
 
149 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  49.62 
 
 
166 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.4 
 
 
255 aa  104  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  47.86 
 
 
157 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  44.09 
 
 
161 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  44.09 
 
 
161 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  44.54 
 
 
156 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  39.71 
 
 
157 aa  100  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  45.45 
 
 
274 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  48.78 
 
 
155 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  48.78 
 
 
155 aa  99  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0750  protein of unknown function UPF0054  41.03 
 
 
165 aa  99.8  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.698652  hitchhiker  0.000447843 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  48.78 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0598  conserved hypothetical protein TIGR00043  40 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  46.83 
 
 
202 aa  99.4  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  48.78 
 
 
155 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  48.78 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  48.78 
 
 
155 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  48.78 
 
 
155 aa  99  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  42.03 
 
 
158 aa  98.6  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  42.86 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44 
 
 
270 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  47.97 
 
 
155 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  47.97 
 
 
155 aa  97.8  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.54 
 
 
245 aa  97.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  37.25 
 
 
149 aa  97.4  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44 
 
 
270 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.34 
 
 
237 aa  96.7  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1185  putative metalloprotease  49.59 
 
 
155 aa  96.7  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  47.01 
 
 
160 aa  96.3  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  40.68 
 
 
155 aa  95.5  3e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>