More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0043 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0043  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, RimI-like protein  100 
 
 
160 aa  320  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0019  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  75 
 
 
160 aa  238  3e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0323693  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0012  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  73.75 
 
 
160 aa  233  1e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.193132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0465  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  70.62 
 
 
161 aa  231  2e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0455  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  69.38 
 
 
161 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  67.5 
 
 
161 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0587  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  68.15 
 
 
161 aa  217  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3396  GCN5-related N-acetyltransferase  50.71 
 
 
173 aa  134  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3524  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
173 aa  132  2e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193717  normal  0.0893278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3200  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
150 aa  131  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.358197  normal  0.871545 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0642  GCN5-related N-acetyltransferase  46.91 
 
 
171 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  0.704084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4431  GCN5-related N-acetyltransferase  46.45 
 
 
160 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110748  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1821  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44.72 
 
 
158 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.477403  normal  0.159791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  47.83 
 
 
160 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.242864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2898  GCN5-related N-acetyltransferase  39.24 
 
 
163 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.288447 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0760  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.42 
 
 
170 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.757602  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  41.26 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  42.65 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_004310  BR2151  acetyltransferase  37.42 
 
 
166 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2064  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.42 
 
 
166 aa  93.2  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.224111  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1757  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.22 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1242  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.88 
 
 
163 aa  87  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2841  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.32 
 
 
139 aa  85.1  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000949861  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.73 
 
 
152 aa  83.2  1e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 
153 aa  83.2  1e-15  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0433  acetyltransferase  32.69 
 
 
165 aa  82  3e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3093  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
144 aa  81.6  4e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3634  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  36.62 
 
 
147 aa  80.9  6e-15  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3505  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  36.62 
 
 
147 aa  80.9  6e-15  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1155  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.13 
 
 
145 aa  80.9  6e-15  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2281  GCN5-related N-acetyltransferase  37.09 
 
 
160 aa  80.1  1e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343647  normal  0.565738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1053  GCN5-related N-acetyltransferase  41.3 
 
 
163 aa  79.3  2e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61880  peptide n-acetyltransferase RimI  36.3 
 
 
150 aa  78.2  5e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355527  normal  0.0211916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5385  peptide n-acetyltransferase RimI  36.62 
 
 
150 aa  77.8  6e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0022  GCN5-related N-acetyltransferase  35.66 
 
 
164 aa  77  9e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.545701 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2212  putative acetyltransferase  36.94 
 
 
160 aa  76.3  1e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3614  GCN5-related N-acetyltransferase  38.24 
 
 
152 aa  77  1e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0887  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.94 
 
 
160 aa  76.3  1e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14178  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
164 aa  76.3  2e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.156182 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1990  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.85 
 
 
160 aa  75.1  3e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0491  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  35.24 
 
 
148 aa  75.1  4e-13  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0038  GCN5-related N-acetyltransferase  34.39 
 
 
167 aa  74.7  5e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  1.42621e-06 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2151  putative acetyltransferase  30.46 
 
 
155 aa  74.3  6e-13  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2098  GCN5-related N-acetyltransferase  37.88 
 
 
166 aa  74.3  6e-13  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.907585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0014  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.04 
 
 
147 aa  74.3  7e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268172  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.62 
 
 
151 aa  73.9  8e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.291315  normal  0.765144 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0828  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.1 
 
 
147 aa  73.6  1e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141904  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  34.4 
 
 
142 aa  73.6  1e-12  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.290046  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  45.78 
 
 
159 aa  72.8  2e-12  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0189  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.5 
 
 
161 aa  72.4  2e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0529  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.03 
 
 
133 aa  72.4  2e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333389  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0983  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.47 
 
 
150 aa  72  3e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570176  normal  0.0327101 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2886  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.58 
 
 
159 aa  72  3e-12  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0991  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  35.21 
 
 
150 aa  72  3e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0274305  hitchhiker  5.84057e-09 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0611  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.39 
 
 
147 aa  72  3e-12  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0697  acetyltransferase  34.93 
 
 
151 aa  71.6  4e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0531  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.73 
 
 
165 aa  71.6  4e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351155  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.93 
 
 
151 aa  71.2  5e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.93 
 
 
151 aa  71.2  5e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.873568  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2383  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.89 
 
 
153 aa  70.9  7e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675937  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.97 
 
 
153 aa  70.9  7e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
147 aa  70.9  8e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2362  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  35.26 
 
 
158 aa  70.5  9e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0987  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.28 
 
 
150 aa  70.1  1e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229607  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.37 
 
 
146 aa  70.1  1e-11  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1294  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.92 
 
 
154 aa  70.1  1e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.73443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002624  ribosomal-protein-S18p-alanine acetyltransferase  31.82 
 
 
151 aa  70.1  1e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4775  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.39 
 
 
150 aa  69.3  2e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1160  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
162 aa  69.3  2e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0651  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.19 
 
 
147 aa  69.7  2e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.067134 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0238  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
147 aa  69.7  2e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00071184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.06 
 
 
150 aa  69.3  2e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588882  normal  0.610129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1048  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.47 
 
 
150 aa  68.9  2e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.070791  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.88 
 
 
147 aa  68.9  3e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4037  GCN5-related N-acetyltransferase  32.06 
 
 
167 aa  68.6  3e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03190  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41 
 
 
160 aa  68.6  3e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
147 aa  68.2  4e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0963  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
157 aa  68.6  4e-11  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0811  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  38.57 
 
 
147 aa  68.6  4e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.823306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
147 aa  68.2  4e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.33 
 
 
147 aa  68.2  4e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0691  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.58 
 
 
152 aa  68.2  4e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.56 
 
 
162 aa  68.2  5e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4042  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34 
 
 
161 aa  67.4  7e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1150  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.16 
 
 
158 aa  67.4  8e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.372343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1167  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.16 
 
 
158 aa  67.4  8e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.508689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42420  acetylating ribosomal protein, RimI  34.31 
 
 
141 aa  67.4  9e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4570  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.21 
 
 
157 aa  67  1e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.64 
 
 
147 aa  66.6  1e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0659  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.71 
 
 
151 aa  66.6  1e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0246  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.77 
 
 
145 aa  66.6  1e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0260  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.77 
 
 
145 aa  66.6  1e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.696152  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1177  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.16 
 
 
158 aa  67  1e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0246629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1843  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.72 
 
 
164 aa  66.2  2e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00686227  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.39 
 
 
149 aa  66.2  2e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129008  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0234  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.64 
 
 
147 aa  66.2  2e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1001  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.67 
 
 
170 aa  66.2  2e-10  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.491632  hitchhiker  0.0014892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3764  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
169 aa  66.2  2e-10  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1396  30S ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.65 
 
 
188 aa  66.2  2e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.547369 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0329  acetyltransferase  33.06 
 
 
156 aa  65.9  2e-10  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>