More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0042 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  100 
 
 
233 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  74.31 
 
 
232 aa  316  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  70.64 
 
 
232 aa  306  2e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  71.17 
 
 
231 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  68.49 
 
 
231 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  69.82 
 
 
230 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  68.35 
 
 
231 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  52.75 
 
 
227 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  49.77 
 
 
226 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  48 
 
 
226 aa  175  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  46.98 
 
 
259 aa  175  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  46.49 
 
 
234 aa  173  2e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  47.51 
 
 
226 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  47.98 
 
 
232 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0643  peptidase M22 glycoprotease  47.71 
 
 
224 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  48.91 
 
 
231 aa  152  3e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  39.91 
 
 
220 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  41.26 
 
 
220 aa  139  4e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  41.3 
 
 
229 aa  138  9e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  42.67 
 
 
218 aa  131  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  1.50711e-06 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  39.11 
 
 
261 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  39.11 
 
 
261 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  39.21 
 
 
225 aa  125  8e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  35.37 
 
 
229 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  39.82 
 
 
213 aa  115  7e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  38.79 
 
 
215 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  40.87 
 
 
230 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  33.33 
 
 
235 aa  105  7e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  40.16 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  40.8 
 
 
237 aa  98.2  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0379  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  34.62 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.457617  hitchhiker  3.59774e-07 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  41.6 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  40.8 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1202  peptidase M22 glycoprotease  33.73 
 
 
248 aa  95.9  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  39.2 
 
 
232 aa  95.1  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  39.2 
 
 
232 aa  95.1  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  39.2 
 
 
232 aa  95.1  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  38.58 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  38.58 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  38.58 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  38.35 
 
 
234 aa  94  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  35.71 
 
 
247 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  36.17 
 
 
233 aa  94  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  35.37 
 
 
224 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  36.44 
 
 
213 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3763  peptidase M22, glycoprotease  42.77 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0183  peptidase M22 glycoprotease  26.41 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.128229  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  37.98 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  37.04 
 
 
224 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  38.58 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  38.58 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  37.21 
 
 
223 aa  92  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  39.37 
 
 
231 aa  92  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  30.36 
 
 
236 aa  91.7  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  37.04 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  39.37 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  39.06 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  36.84 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  34.48 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  38.58 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  38.58 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  38.58 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  38.58 
 
 
231 aa  90.1  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  38.58 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  38.58 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  41.73 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  38.58 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  2.8735e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  39.2 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  38.4 
 
 
233 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  36.3 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  38.58 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  39.2 
 
 
233 aa  89.4  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  38.1 
 
 
239 aa  89  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  27.51 
 
 
223 aa  88.2  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  31.58 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  28.88 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  36.23 
 
 
228 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  36.22 
 
 
239 aa  87  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  36 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  36.3 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  38.35 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0540  peptidase M22, glycoprotease  29.26 
 
 
230 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714565  unclonable  1.26844e-09 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  36.8 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  33.2 
 
 
237 aa  86.3  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  34.56 
 
 
233 aa  85.5  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  33.48 
 
 
225 aa  85.5  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1747  glycoprotein endopeptidase  32.58 
 
 
228 aa  85.1  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.3762  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  33.07 
 
 
241 aa  84.7  1e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0863  peptidase M22, glycoprotease  43.41 
 
 
215 aa  84.3  1e-15  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07480  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  35.11 
 
 
225 aa  84.3  1e-15  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.308206  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  35.56 
 
 
239 aa  84.3  1e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  35.86 
 
 
226 aa  84.3  1e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  38.35 
 
 
237 aa  83.6  2e-15  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  38.35 
 
 
237 aa  83.6  2e-15  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  34.36 
 
 
229 aa  84.3  2e-15  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  30.53 
 
 
224 aa  83.6  2e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  38.35 
 
 
237 aa  83.6  2e-15  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2256  peptidase M22 glycoprotease  40.74 
 
 
244 aa  84  2e-15  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0343569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  35.03 
 
 
236 aa  84  2e-15  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  38.35 
 
 
237 aa  83.6  2e-15  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>