More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0037 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0037  putative virulence factor MviN-like protein  100 
 
 
518 aa  980  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236522  normal  0.272739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0011  integral membrane protein MviN  60.81 
 
 
529 aa  514  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295348  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0250  integral membrane protein MviN  60.27 
 
 
518 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0714023  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0460  integral membrane protein MviN  59.88 
 
 
518 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0458  integral membrane protein MviN  67.87 
 
 
537 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0217  virulence factor MVIN-like  58.69 
 
 
533 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0582  integral membrane protein MviN  59.3 
 
 
518 aa  453  1e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0591354  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  36.38 
 
 
529 aa  272  9e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  36.86 
 
 
520 aa  266  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  38.74 
 
 
512 aa  262  9e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  36.57 
 
 
555 aa  259  8e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  36.69 
 
 
529 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  35.92 
 
 
526 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  36.36 
 
 
528 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  39.13 
 
 
509 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  39.13 
 
 
509 aa  236  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  35.85 
 
 
543 aa  236  1e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  38.5 
 
 
535 aa  235  1e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  2.09824e-05 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  37.57 
 
 
528 aa  235  2e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  37.78 
 
 
532 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  36.22 
 
 
509 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  35.55 
 
 
509 aa  223  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  36.08 
 
 
513 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  36.53 
 
 
514 aa  223  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  35.88 
 
 
513 aa  223  1e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  39.01 
 
 
508 aa  220  4e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3497  integral membrane protein MviN  38.67 
 
 
509 aa  219  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319117  normal  0.680185 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  34.56 
 
 
513 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  35.53 
 
 
509 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  29.35 
 
 
495 aa  217  3e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  36.1 
 
 
508 aa  216  7e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  37.92 
 
 
514 aa  214  3e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  37.55 
 
 
513 aa  211  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  35.71 
 
 
534 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  35.8 
 
 
509 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  37.41 
 
 
522 aa  206  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  35.76 
 
 
525 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  31.63 
 
 
511 aa  206  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  35.44 
 
 
534 aa  206  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  37.76 
 
 
509 aa  203  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  30.69 
 
 
524 aa  198  2e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  30.69 
 
 
524 aa  198  2e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  30.69 
 
 
524 aa  198  2e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  30.46 
 
 
511 aa  198  2e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  32.11 
 
 
521 aa  198  2e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  32.08 
 
 
511 aa  198  2e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  30.69 
 
 
524 aa  198  2e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  30.69 
 
 
524 aa  198  2e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  37.91 
 
 
508 aa  197  4e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.342174 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  32.55 
 
 
511 aa  197  5e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  34.65 
 
 
513 aa  196  8e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  33.25 
 
 
511 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  33.25 
 
 
511 aa  195  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  33.25 
 
 
511 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  33.25 
 
 
511 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  33.25 
 
 
511 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  33.25 
 
 
511 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  33.25 
 
 
511 aa  195  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  33.25 
 
 
511 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  33.25 
 
 
511 aa  195  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  30.71 
 
 
508 aa  193  8e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  32.91 
 
 
512 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  30.14 
 
 
511 aa  192  9e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  30.55 
 
 
511 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  35.21 
 
 
515 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  32.83 
 
 
512 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  30.92 
 
 
528 aa  191  3e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  30.72 
 
 
505 aa  191  3e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  30.67 
 
 
512 aa  191  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  33.79 
 
 
530 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5302  integral membrane protein MviN  38.58 
 
 
509 aa  190  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  32.62 
 
 
512 aa  190  6e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  32.08 
 
 
542 aa  190  6e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  30.91 
 
 
512 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  32.08 
 
 
511 aa  189  8e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  33.71 
 
 
518 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  34.34 
 
 
512 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  33.72 
 
 
522 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  34.47 
 
 
529 aa  187  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  31.35 
 
 
501 aa  187  5e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  33.49 
 
 
512 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  32.2 
 
 
522 aa  186  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  32.48 
 
 
511 aa  186  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  39.13 
 
 
510 aa  186  1e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  33.42 
 
 
512 aa  186  1e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  6.10736e-05 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  32.43 
 
 
530 aa  185  2e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  34.4 
 
 
509 aa  185  2e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  30.69 
 
 
528 aa  184  4e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  31.51 
 
 
516 aa  183  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  31.52 
 
 
530 aa  183  8e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  32.99 
 
 
516 aa  182  9e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  32.35 
 
 
517 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  30.17 
 
 
521 aa  181  3e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2251  membrane protein MviN  37.24 
 
 
513 aa  181  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0136199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0372  integral membrane protein MviN  34.47 
 
 
519 aa  181  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  31.86 
 
 
514 aa  180  6e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  32.93 
 
 
513 aa  180  6e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  31.02 
 
 
522 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  7.67469e-06 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  29.51 
 
 
523 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  29.26 
 
 
519 aa  177  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.57421e-05  normal  0.416972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>