More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0036 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  100 
 
 
333 aa  673  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  78.25 
 
 
333 aa  517  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  79.15 
 
 
333 aa  516  1e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  75.83 
 
 
333 aa  516  1e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  78.25 
 
 
333 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  78.38 
 
 
333 aa  510  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  76.13 
 
 
333 aa  493  1e-138  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  64.13 
 
 
331 aa  417  1e-115  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  62.54 
 
 
333 aa  414  1e-115  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  59.82 
 
 
335 aa  413  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  64.13 
 
 
331 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  60.73 
 
 
333 aa  400  1e-110  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  59.52 
 
 
337 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  59.52 
 
 
337 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  60.12 
 
 
337 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  58.98 
 
 
337 aa  381  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  56.1 
 
 
330 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  56.1 
 
 
330 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  55.93 
 
 
331 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  56.84 
 
 
330 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  57.36 
 
 
407 aa  362  4e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  55.73 
 
 
337 aa  353  3e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  52.91 
 
 
330 aa  352  6e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  55.83 
 
 
328 aa  350  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  54.88 
 
 
330 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  53.45 
 
 
338 aa  342  6e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  51.06 
 
 
342 aa  337  2e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  52.6 
 
 
330 aa  336  4e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  51.99 
 
 
330 aa  332  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  54.27 
 
 
329 aa  332  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  51.7 
 
 
338 aa  320  2e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  51.37 
 
 
331 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  51.54 
 
 
337 aa  313  3e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  50 
 
 
332 aa  311  7e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  49.85 
 
 
338 aa  302  5e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  43.96 
 
 
348 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  50.46 
 
 
330 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  50.15 
 
 
330 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  44.72 
 
 
335 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  45.03 
 
 
335 aa  295  8e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  51.68 
 
 
330 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  39.88 
 
 
334 aa  273  2e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  38.82 
 
 
338 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  40.5 
 
 
333 aa  271  8e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  40.19 
 
 
333 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  49.06 
 
 
330 aa  265  6e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  42.99 
 
 
331 aa  255  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  42.51 
 
 
330 aa  254  2e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  42.64 
 
 
333 aa  238  9e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  41.09 
 
 
335 aa  229  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  42.9 
 
 
333 aa  228  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  38.41 
 
 
328 aa  205  9e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  36.67 
 
 
336 aa  201  1e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  35.87 
 
 
327 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  35.87 
 
 
327 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  34.18 
 
 
328 aa  186  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  3.92808e-12  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  34.24 
 
 
331 aa  185  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
330 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  1.89129e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  34.92 
 
 
370 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  30.68 
 
 
341 aa  166  7e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.73033e-09  unclonable  4.72438e-10 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  32.51 
 
 
339 aa  164  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  4.68276e-06  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  31.89 
 
 
339 aa  160  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  7.04659e-14  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  35.85 
 
 
360 aa  160  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  33.12 
 
 
334 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 
328 aa  137  3e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.1716e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  34.09 
 
 
300 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  32.33 
 
 
309 aa  99.4  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  31.72 
 
 
297 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  32.47 
 
 
288 aa  96.7  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  31.02 
 
 
304 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  29.96 
 
 
273 aa  90.9  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  32.95 
 
 
303 aa  89.7  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  29.03 
 
 
347 aa  89  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  34.3 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  28.83 
 
 
305 aa  86.7  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  32.92 
 
 
296 aa  85.9  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  29.7 
 
 
317 aa  82.8  7e-15  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.17 
 
 
304 aa  82  1e-14  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  30.49 
 
 
324 aa  82  1e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  24.11 
 
 
328 aa  81.3  2e-14  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  30.71 
 
 
309 aa  80.9  3e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  32.33 
 
 
301 aa  80.1  4e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  28.73 
 
 
298 aa  80.1  5e-14  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  28.73 
 
 
297 aa  80.1  5e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  28.63 
 
 
305 aa  79.3  7e-14  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  29.45 
 
 
307 aa  77.4  3e-13  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.50833e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  28.28 
 
 
645 aa  76.3  8e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  26.43 
 
 
304 aa  75.5  1e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  27.92 
 
 
314 aa  75.9  1e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 
293 aa  75.5  1e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  29.31 
 
 
305 aa  74.3  2e-12  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  22.92 
 
 
328 aa  75.1  2e-12  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  32.54 
 
 
316 aa  74.7  2e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  26.9 
 
 
302 aa  74.3  3e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  29.24 
 
 
301 aa  73.9  3e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  25 
 
 
328 aa  73.9  4e-12  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  29.23 
 
 
304 aa  73.6  5e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02130  adenosine kinase, putative  27.1 
 
 
357 aa  72.8  8e-12  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  25.83 
 
 
320 aa  72  1e-11  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  26.59 
 
 
304 aa  72  1e-11  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>