More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0032 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.32 
 
 
483 aa  651  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.32 
 
 
483 aa  641  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  66.46 
 
 
500 aa  643  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  69.96 
 
 
483 aa  702  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0255  succinic semialdehyde dehydrogenase  82.13 
 
 
497 aa  813  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666888  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0454  succinic semialdehyde dehydrogenase  81.93 
 
 
497 aa  801  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2568  succinic semialdehyde dehydrogenase  68.91 
 
 
486 aa  679  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.951924  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.73 
 
 
483 aa  654  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3136  succinic semialdehyde dehydrogenase  69.33 
 
 
483 aa  668  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0465  succinic semialdehyde dehydrogenase  83.94 
 
 
497 aa  816  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0577  succinic semialdehyde dehydrogenase  82.73 
 
 
497 aa  810  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289417  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0032  succinate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
498 aa  1010  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105667  normal  0.227937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.3 
 
 
480 aa  635  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.57 
 
 
503 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.92 
 
 
486 aa  631  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.69 
 
 
483 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.33 
 
 
486 aa  630  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.86 
 
 
503 aa  631  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.92 
 
 
480 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.41 
 
 
484 aa  629  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.67 
 
 
489 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.92 
 
 
480 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.91 
 
 
485 aa  625  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.65393e-18 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.84 
 
 
489 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.84 
 
 
489 aa  622  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.84 
 
 
489 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.84 
 
 
489 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.05 
 
 
489 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.05 
 
 
489 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.05 
 
 
489 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.84 
 
 
489 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  62.84 
 
 
489 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.05 
 
 
489 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.84 
 
 
489 aa  621  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.84 
 
 
489 aa  620  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.16 
 
 
484 aa  620  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.63 
 
 
489 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.2 
 
 
488 aa  619  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.71 
 
 
485 aa  621  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.11 
 
 
484 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.38 
 
 
482 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.63 
 
 
482 aa  616  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.38 
 
 
482 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0580  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.18 
 
 
480 aa  616  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.08 
 
 
486 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.08 
 
 
480 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.38 
 
 
482 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.08 
 
 
480 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  61 
 
 
493 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  60.91 
 
 
509 aa  615  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.38 
 
 
482 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.88 
 
 
480 aa  613  1e-174  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.96 
 
 
488 aa  613  1e-174  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.95 
 
 
492 aa  611  1e-174  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.88 
 
 
480 aa  614  1e-174  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.47 
 
 
496 aa  612  1e-174  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.24 
 
 
492 aa  612  1e-174  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  62.63 
 
 
480 aa  611  1e-174  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.41 
 
 
486 aa  613  1e-174  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  5.30591e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.17 
 
 
482 aa  612  1e-174  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.16 
 
 
493 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  61.17 
 
 
482 aa  610  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.4 
 
 
490 aa  609  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.75 
 
 
482 aa  609  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.25 
 
 
482 aa  610  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  60 
 
 
482 aa  605  1e-172  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.42 
 
 
482 aa  607  1e-172  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.33 
 
 
482 aa  606  1e-172  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.96 
 
 
482 aa  608  1e-172  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.42 
 
 
482 aa  604  1e-172  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  60.96 
 
 
482 aa  608  1e-172  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 
493 aa  605  1e-172  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.62 
 
 
482 aa  606  1e-172  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6540  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.69 
 
 
484 aa  606  1e-172  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.142006 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  60.96 
 
 
482 aa  608  1e-172  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4212  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.81 
 
 
489 aa  607  1e-172  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.54 
 
 
482 aa  608  1e-172  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.21 
 
 
482 aa  605  1e-172  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.75 
 
 
482 aa  606  1e-172  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.75 
 
 
490 aa  602  1e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.08 
 
 
484 aa  603  1e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.3 
 
 
484 aa  602  1e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.84 
 
 
493 aa  603  1e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  60 
 
 
482 aa  603  1e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.84 
 
 
482 aa  602  1e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2324  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.02 
 
 
492 aa  600  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.832005  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.09 
 
 
483 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.84 
 
 
482 aa  598  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.67 
 
 
489 aa  598  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.12 
 
 
500 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.35 
 
 
492 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.42 
 
 
482 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.01 
 
 
479 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  60.58 
 
 
491 aa  597  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.41 
 
 
490 aa  596  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3225  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.91 
 
 
486 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00532289  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.05 
 
 
481 aa  595  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2672  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.15 
 
 
492 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  60.21 
 
 
488 aa  594  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1012  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.15 
 
 
511 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>