More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0030 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0030  sulfate transporter  100 
 
 
734 aa  1461  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127752  normal  0.27039 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  31.92 
 
 
749 aa  313  8e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  28.81 
 
 
739 aa  297  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  27.42 
 
 
721 aa  280  7e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  27.56 
 
 
721 aa  279  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  26.89 
 
 
729 aa  260  6e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1175  sulphate transporter  31.25 
 
 
730 aa  256  1e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0317024  normal  0.332491 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0635  putative sulfate permease with cyclic nucleotide-binding domain  29.49 
 
 
733 aa  229  9e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0466798  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0366  putative sulfate transporter  27.35 
 
 
727 aa  218  3e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.972082  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  27.33 
 
 
731 aa  180  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00680  vacuole protein, putative  26.3 
 
 
1177 aa  177  6e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0220987  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03665  sulfate transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12440)  26.55 
 
 
1053 aa  164  4e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85698  sulfate transporter Sulfate/bicarbonate/oxalate exchanger SAT-1 and related transporters (SLC26 family)  24.25 
 
 
963 aa  159  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.525688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3904  cyclic nucleotide-binding:Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  24.17 
 
 
736 aa  152  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50075  predicted protein  22.88 
 
 
955 aa  140  8e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42556  predicted protein  23.47 
 
 
964 aa  130  1e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162025  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50333  predicted protein  24.74 
 
 
619 aa  105  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1983  sulphate transporter  24.63 
 
 
509 aa  103  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0343473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  23.2 
 
 
747 aa  99  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  23.35 
 
 
563 aa  97.8  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02341  putative sulfate transporter  24.63 
 
 
577 aa  97.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02351  putative sulfate transporter  24.29 
 
 
550 aa  95.1  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.779533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  23.38 
 
 
563 aa  95.1  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  2.13177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  22.73 
 
 
570 aa  94.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02441  putative sulfate transporter  24.16 
 
 
551 aa  94.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02331  putative sulfate transporter  24.2 
 
 
550 aa  93.6  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.868992  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  24.18 
 
 
575 aa  93.2  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0216  putative sulfate transporter  24.03 
 
 
550 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  25.17 
 
 
572 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02911  putative sulfate transporter  25.31 
 
 
555 aa  92  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1108  sulphate transporter  25 
 
 
583 aa  90.9  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  23.43 
 
 
579 aa  90.1  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07961  putative sulfate transporter  24.18 
 
 
573 aa  90.5  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1831  putative sulfate transporter  24.87 
 
 
560 aa  90.5  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.505905  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0985  putative sulfate transporter  23.79 
 
 
549 aa  89  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1592  sulphate transporter  21.91 
 
 
519 aa  88.2  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.795484  normal  0.0437766 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1581  putative sulfate transporter  24.34 
 
 
555 aa  87.8  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  23.95 
 
 
573 aa  87  1e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1838  sulphate transporter  23.64 
 
 
509 aa  87  1e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0615  sulphate transporter  26.34 
 
 
540 aa  85.9  2e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0689  sulfate permease family protein  21.97 
 
 
483 aa  85.9  2e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0381157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3363  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  25.37 
 
 
481 aa  84.7  5e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1080  sulphate transporter  24.27 
 
 
540 aa  85.1  5e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.610745  normal  0.0982504 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22210  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  23.15 
 
 
601 aa  84.7  6e-15  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2603  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32829  SulP family transporter: sulfate; sulfate transporter of the Major Facilitator Superfamily (MFS)  22.83 
 
 
509 aa  84  9e-15  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2208  sulphate transporter  23.77 
 
 
512 aa  83.2  1e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  23.46 
 
 
574 aa  83.6  1e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  27.63 
 
 
624 aa  83.6  1e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3593  sulfate permease family protein  25.8 
 
 
481 aa  83.6  1e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2371  sulphate transporter  23.55 
 
 
604 aa  82.4  3e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1906  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  27.77 
 
 
562 aa  82  3e-14  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2658  sulphate transporter  22.27 
 
 
519 aa  81.6  4e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  6.74443e-06  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1749  sulphate transporter  22.27 
 
 
519 aa  81.6  4e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  3.11132e-05  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1709  sulphate transporter  22.27 
 
 
519 aa  81.3  5e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.77165e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4649  sulfate permease family protein  21.34 
 
 
483 aa  80.9  7e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000779975  unclonable  1.77501e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0743  sulphate transporter  25 
 
 
594 aa  80.9  8e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1706  sulphate transporter  22.47 
 
 
519 aa  80.9  8e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.6912e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  24.05 
 
 
551 aa  80.5  1e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  23.13 
 
 
552 aa  80.1  1e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0549  sulphate transporter  21.97 
 
 
483 aa  79.3  2e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  24.01 
 
 
606 aa  79.7  2e-13  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02853  low affinity sulfate transporter  25.32 
 
 
545 aa  79.7  2e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02920  hypothetical protein  27.54 
 
 
519 aa  79  3e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1650  sulphate transporter  23.93 
 
 
511 aa  79  3e-13  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002987  sulfate permease  27.54 
 
 
504 aa  79  3e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1231  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 
521 aa  79  3e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  22.49 
 
 
563 aa  79  3e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  22.84 
 
 
588 aa  78.2  5e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  24.16 
 
 
587 aa  78.2  5e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  22.83 
 
 
551 aa  78.2  5e-13  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  22.94 
 
 
605 aa  78.2  5e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  21.01 
 
 
568 aa  78.2  5e-13  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0497  putative sulfate transporter YchM  24.38 
 
 
565 aa  78.2  5e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0504  putative sulfate transporter  25.89 
 
 
558 aa  78.2  5e-13  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.602665  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  23.92 
 
 
554 aa  78.2  6e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03661  Sulfate permease family protein  23.42 
 
 
521 aa  77.8  6e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4725  sulphate transporter  21.62 
 
 
561 aa  77.8  6e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  24.75 
 
 
581 aa  77.8  7e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1867  sulphate transporter  22.82 
 
 
557 aa  77.8  7e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0781  sulphate transporter  23 
 
 
489 aa  77.4  8e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  22.52 
 
 
583 aa  77.4  8e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1990  sulphate transporter  21.52 
 
 
518 aa  77.4  8e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638858  normal  0.0857546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3685  sulphate transporter  25.59 
 
 
480 aa  76.6  1e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0439224  normal  0.0112411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4452  sulphate transporter  23.08 
 
 
512 aa  77  1e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248248  normal  0.0871975 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0782  sulfate permease family protein  21.64 
 
 
483 aa  77  1e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  21.76 
 
 
560 aa  77  1e-12  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2681  sulphate transporter  22.97 
 
 
504 aa  76.6  1e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.529175 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0891  putative sulfate transporter  22.27 
 
 
565 aa  76.6  1e-12  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  23.33 
 
 
572 aa  77  1e-12  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0024  sulfate permease family protein  21.63 
 
 
483 aa  77  1e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0608  sulphate transporter  26.92 
 
 
521 aa  75.9  2e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000167283  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3386  sulphate transporter  25 
 
 
480 aa  75.9  2e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4228  sulphate transporter  25.1 
 
 
536 aa  76.3  2e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2505  sulphate transporter  22.94 
 
 
519 aa  75.9  3e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4401  sulfate transporter  23.05 
 
 
489 aa  75.9  3e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.840656  hitchhiker  1.31237e-09 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3557  sulphate transporter  24.3 
 
 
481 aa  75.5  3e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.179544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  23.13 
 
 
711 aa  75.9  3e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  1.3918e-05 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2303  sulphate transporter  23.36 
 
 
519 aa  75.1  4e-12  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0653  sulfate permease family protein  22.27 
 
 
483 aa  74.7  6e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0930  sulfate transporter  22.81 
 
 
489 aa  74.7  6e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>