55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0026 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  100 
 
 
234 aa  469  1e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  58.41 
 
 
231 aa  249  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  42.13 
 
 
223 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  41.59 
 
 
223 aa  179  5e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  41.59 
 
 
223 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  41.59 
 
 
223 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  41.67 
 
 
223 aa  174  1e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  41.67 
 
 
223 aa  174  1e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  40.83 
 
 
220 aa  171  8e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  41.59 
 
 
221 aa  171  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  43.9 
 
 
248 aa  163  2e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  47.15 
 
 
230 aa  163  2e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  47.85 
 
 
268 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  46.81 
 
 
225 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  39.58 
 
 
250 aa  126  2e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.50269e-05 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  42.79 
 
 
222 aa  125  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2186  uridine kinase  39.17 
 
 
223 aa  125  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.717082  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  37.8 
 
 
164 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  37.93 
 
 
207 aa  96.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2745  hypothetical protein  53.73 
 
 
154 aa  71.6  9e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1887  hypothetical protein  28.9 
 
 
208 aa  70.5  2e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4235  hypothetical protein  30.3 
 
 
216 aa  69.7  4e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2807  uridine kinase  29.63 
 
 
189 aa  68.9  6e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.560437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2233  uridine kinase  27.05 
 
 
193 aa  68.9  7e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640057  hitchhiker  1.80687e-08 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4433  uridine kinase  25.13 
 
 
209 aa  66.2  4e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3045  uridine kinase  27.88 
 
 
193 aa  65.5  6e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3044  uridine kinase  26.78 
 
 
191 aa  65.1  8e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11578  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2744  hypothetical protein  40.86 
 
 
105 aa  65.1  9e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1177  hypothetical protein  31.58 
 
 
209 aa  64.3  1e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0707692 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2797  uridine kinase  25.12 
 
 
193 aa  63.9  2e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3009  uridine kinase  25.12 
 
 
193 aa  63.9  2e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1411  hypothetical protein  34.17 
 
 
202 aa  62.8  4e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466513  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3008  uridine kinase  26.57 
 
 
193 aa  62.8  4e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3007  uridine kinase  25.12 
 
 
193 aa  62  7e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.16402e-05 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2728  uridine kinase  24.15 
 
 
193 aa  60.5  2e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10760  hypothetical protein  30.77 
 
 
214 aa  60.1  3e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.729368  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16890  hypothetical protein  27.23 
 
 
208 aa  56.2  4e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144675  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0839  hypothetical protein  33.57 
 
 
211 aa  55.8  5e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  24.46 
 
 
198 aa  52  7e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.77655e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2748  uridine kinase  26.09 
 
 
193 aa  50.4  3e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.42955e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  28.32 
 
 
207 aa  49.3  5e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  23.91 
 
 
198 aa  49.3  5e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  31.41 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1086  hypothetical protein  37.18 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7532  hypothetical protein  37.18 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  29.89 
 
 
210 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  26.74 
 
 
208 aa  46.6  0.0004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.66982e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  28.74 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3095  uridine kinase  46.67 
 
 
63 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000413913  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  28.48 
 
 
211 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3098  uridine kinase  44.44 
 
 
74 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.444775  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  24.6 
 
 
207 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  25.2 
 
 
198 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  23.98 
 
 
216 aa  42.4  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  25.4 
 
 
207 aa  42  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>