16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0022 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0022  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  249  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831793  normal  0.341515 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1535  hypothetical protein  39.45 
 
 
125 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1559  hypothetical protein  39.45 
 
 
125 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571347  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0612  hypothetical protein  39.45 
 
 
125 aa  86.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0376517  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1331  hypothetical protein  39.45 
 
 
125 aa  86.7  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0543  hypothetical protein  39.45 
 
 
125 aa  86.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1731  hypothetical protein  39.45 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0813  hypothetical protein  39.45 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.37773  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2268  hypothetical protein  39.05 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000109441  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4554  hypothetical protein  39.05 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2993  hypothetical protein  34.55 
 
 
124 aa  78.6  3e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7624  hypothetical protein  28.07 
 
 
124 aa  65.5  2e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.134101  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2576  hypothetical protein  35.09 
 
 
128 aa  62  2e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.871718  normal  0.0119446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3993  hypothetical protein  29.82 
 
 
149 aa  48.5  3e-05  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4575  hypothetical protein  25.49 
 
 
150 aa  48.5  3e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621123  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3488  hypothetical protein  26.55 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>