83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0015 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  744  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  63.16 
 
 
377 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0565  hypothetical protein  62.73 
 
 
370 aa  357  2e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0368  hypothetical protein  60.44 
 
 
378 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0145  hypothetical protein  60.63 
 
 
371 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0706  hypothetical protein  60.46 
 
 
373 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  41.33 
 
 
361 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  41.28 
 
 
363 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2601  hypothetical protein  34.97 
 
 
371 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220305  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  35.04 
 
 
363 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  37.38 
 
 
376 aa  105  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  33.56 
 
 
359 aa  73.2  7e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  26.21 
 
 
347 aa  68.6  2e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  25.6 
 
 
338 aa  67.4  4e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  30.92 
 
 
395 aa  63.2  8e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  28.49 
 
 
360 aa  60.1  7e-08  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  32.79 
 
 
350 aa  58.2  3e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  29.35 
 
 
727 aa  54.3  4e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.35 
 
 
727 aa  53.9  4e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0473  membrane protein-like protein  27.95 
 
 
764 aa  53.9  4e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  30.29 
 
 
189 aa  52  2e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  28.47 
 
 
238 aa  50.8  3e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4804  membrane protein-like protein  30.87 
 
 
352 aa  50.8  4e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.88 
 
 
727 aa  50.8  4e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.88 
 
 
727 aa  50.4  5e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.88 
 
 
727 aa  50.4  5e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  29.15 
 
 
673 aa  50.1  7e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  29.15 
 
 
673 aa  50.1  7e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  29.15 
 
 
673 aa  50.1  7e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.38 
 
 
727 aa  49.7  8e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2038  membrane protein-like protein  25.77 
 
 
184 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0752149  normal  0.0532499 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2051  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.18 
 
 
752 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.81 
 
 
719 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1951  conserved hypothetical conserved membrane protein  29.41 
 
 
677 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126596  normal  0.313547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  33.08 
 
 
724 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  25.21 
 
 
725 aa  47  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  28.17 
 
 
272 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.74 
 
 
724 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  20.45 
 
 
721 aa  46.6  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  27.78 
 
 
189 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  28.4 
 
 
269 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  30.38 
 
 
188 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  23.65 
 
 
732 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  23.46 
 
 
717 aa  46.6  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  25.13 
 
 
712 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.19105e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3993  hypothetical protein  28.69 
 
 
356 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0182739  normal  0.26526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  24.26 
 
 
727 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  29.76 
 
 
676 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  25.13 
 
 
712 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  28.4 
 
 
197 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1215  hypothetical protein  28.4 
 
 
197 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  25.13 
 
 
712 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1207  hypothetical protein  28.4 
 
 
197 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  28.4 
 
 
197 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  27.92 
 
 
432 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.27 
 
 
746 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  28.4 
 
 
197 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.69 
 
 
653 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  27.27 
 
 
188 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  27.23 
 
 
725 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  27.27 
 
 
188 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  28.17 
 
 
725 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  29.75 
 
 
188 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  27.95 
 
 
600 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2587  hypothetical protein  30.41 
 
 
638 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.121215 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  27.27 
 
 
188 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2162  conserved hypothetical conserved membrane protein  27.45 
 
 
679 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547772  normal  0.0766716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  23.65 
 
 
732 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  20.11 
 
 
730 aa  43.9  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  27.69 
 
 
704 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  26.23 
 
 
717 aa  43.9  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  36.36 
 
 
635 aa  43.5  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  20.44 
 
 
733 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  28.57 
 
 
728 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4189  hypothetical protein  31.2 
 
 
487 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  28.76 
 
 
702 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  25.35 
 
 
189 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  26.76 
 
 
725 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6606  hypothetical protein  31.29 
 
 
638 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213555  normal  0.251214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  26.76 
 
 
725 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3247  integral membrane protein, YccS/YhfK  28.21 
 
 
733 aa  42.7  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1137  hypothetical protein  24.61 
 
 
640 aa  42.7  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.82 
 
 
708 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  2.97127e-08  normal  0.375768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>