More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0005 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  100 
 
 
123 aa  253  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  100 
 
 
123 aa  253  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  100 
 
 
123 aa  253  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  100 
 
 
123 aa  253  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  100 
 
 
123 aa  253  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  82 
 
 
104 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  82 
 
 
104 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  82 
 
 
104 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  58.41 
 
 
121 aa  139  1e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  58.41 
 
 
121 aa  139  1e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  58.41 
 
 
121 aa  139  1e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  58.41 
 
 
121 aa  139  1e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  58.41 
 
 
121 aa  139  1e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  58.41 
 
 
121 aa  139  1e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  58.41 
 
 
121 aa  139  1e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  58.41 
 
 
121 aa  139  1e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  58.41 
 
 
121 aa  139  1e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  58.41 
 
 
121 aa  139  1e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  58.41 
 
 
121 aa  139  2e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  58.41 
 
 
121 aa  139  2e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  59.13 
 
 
132 aa  139  2e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  59.13 
 
 
132 aa  139  2e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  58.41 
 
 
121 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  55.05 
 
 
123 aa  132  2e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  55.05 
 
 
123 aa  132  2e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  55.05 
 
 
123 aa  132  2e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  54.55 
 
 
252 aa  132  2e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  53.21 
 
 
142 aa  127  7e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  53.21 
 
 
142 aa  127  7e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  51.38 
 
 
142 aa  125  2e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  52.78 
 
 
142 aa  123  8e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  52.78 
 
 
142 aa  123  8e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  52.88 
 
 
254 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  52.88 
 
 
254 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  52.88 
 
 
254 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  52.88 
 
 
254 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  52.88 
 
 
254 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  50.96 
 
 
254 aa  117  8e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  50.96 
 
 
254 aa  117  8e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  50.96 
 
 
254 aa  117  8e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  50.96 
 
 
254 aa  117  8e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  50.96 
 
 
254 aa  117  8e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  50.96 
 
 
254 aa  117  8e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  47.37 
 
 
132 aa  115  2e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  47.37 
 
 
132 aa  115  2e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  47.37 
 
 
132 aa  115  2e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  47.37 
 
 
132 aa  115  2e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  47.37 
 
 
132 aa  115  2e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  47.37 
 
 
132 aa  115  2e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  47.37 
 
 
132 aa  115  2e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  47.37 
 
 
132 aa  115  2e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  47.37 
 
 
132 aa  115  2e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  47.37 
 
 
132 aa  115  2e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  47.37 
 
 
132 aa  115  2e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  47.37 
 
 
132 aa  115  2e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  47.37 
 
 
124 aa  114  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  47.37 
 
 
124 aa  114  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  46.79 
 
 
124 aa  112  1e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  48.67 
 
 
260 aa  112  2e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  48.25 
 
 
260 aa  112  2e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  51.33 
 
 
139 aa  112  2e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  48.25 
 
 
260 aa  112  2e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  44.17 
 
 
121 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  44.17 
 
 
121 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  44.17 
 
 
121 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.25 
 
 
251 aa  110  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  50.93 
 
 
144 aa  110  8e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  40.83 
 
 
125 aa  110  8e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  47.32 
 
 
122 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2821  ISBm1, transposase orfA  59.76 
 
 
87 aa  110  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6122  putative transposase  50.42 
 
 
141 aa  109  1e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  46.96 
 
 
259 aa  109  1e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0549  hypothetical protein  40.83 
 
 
125 aa  108  2e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  44.07 
 
 
158 aa  108  2e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4170  transposase  43.86 
 
 
124 aa  108  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  47.37 
 
 
273 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  48.36 
 
 
149 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.46608e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  49.07 
 
 
111 aa  108  4e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0077  transposase  45 
 
 
139 aa  107  4e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  46.36 
 
 
255 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.86 
 
 
281 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  45.05 
 
 
157 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  39.29 
 
 
253 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  50.44 
 
 
251 aa  103  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  50.44 
 
 
251 aa  103  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  39.29 
 
 
253 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  39.29 
 
 
253 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  39.29 
 
 
253 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  45.9 
 
 
125 aa  104  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  45.05 
 
 
135 aa  102  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  45.05 
 
 
129 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  45.05 
 
 
129 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  45.05 
 
 
129 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  45.05 
 
 
129 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  45.05 
 
 
129 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  45.05 
 
 
129 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  41.9 
 
 
117 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  41.9 
 
 
117 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  41.9 
 
 
117 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  41.9 
 
 
117 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>