219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS5134 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS5134  ABC transporter ATP-binding protein, C-terminus  100 
 
 
137 aa  278  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5406  ABC transporter, ATP-binding protein  94.16 
 
 
335 aa  269  9e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.3143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4985  ABC transporter, ATP-binding protein  98.33 
 
 
335 aa  247  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000703532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5376  ABC transporter, ATP-binding protein  98.33 
 
 
335 aa  247  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000218123 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4967  ABC transporter ATP-binding protein  98.33 
 
 
335 aa  247  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000811846  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5083  LytTr DNA-binding region  98.29 
 
 
335 aa  242  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000635558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5461  ABC transporter, ATP-binding protein  97.44 
 
 
335 aa  241  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5410  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  96.58 
 
 
335 aa  240  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5544  ABC transporter, ATP-binding protein  96.58 
 
 
335 aa  239  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000378765  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3804  LytTr DNA-binding region  86.86 
 
 
335 aa  225  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2673  ABC transporter related protein  49.53 
 
 
330 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3599  response regulator receiver protein  40.48 
 
 
373 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.485961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  43.44 
 
 
253 aa  92.8  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
255 aa  88.6  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.09 
 
 
251 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
252 aa  87.8  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.23 
 
 
260 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.09 
 
 
268 aa  84.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
240 aa  82  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.23 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  33.07 
 
 
254 aa  80.5  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  40.7 
 
 
250 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
262 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2171  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.35 
 
 
249 aa  73.6  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0294549  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.62 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1879  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.35 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  35.77 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.96 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2443  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.62 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.69 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  30.69 
 
 
243 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  30.69 
 
 
243 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  37.5 
 
 
238 aa  71.2  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  30.69 
 
 
243 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  30.69 
 
 
243 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  30.69 
 
 
243 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.61 
 
 
237 aa  70.5  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  31.73 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2448  LytTr DNA-binding region  31.25 
 
 
478 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.269768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  30.77 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.77 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  30.77 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2822  response regulator receiver domain-containing protein  34.82 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135551  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.37 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  30.77 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  30.77 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  30.77 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  30.77 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  30.77 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0619  response regulator receiver protein  35.14 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0056  response regulator  33.33 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2221  response regulator receiver protein  30.77 
 
 
309 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  32.11 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  32.11 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  30.36 
 
 
257 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1495  putative PAS/PAC sensor protein  30.97 
 
 
234 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5512  putative response regulator  27.68 
 
 
238 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5097  response regulator  27.68 
 
 
238 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5546  response regulator, putative  27.68 
 
 
238 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5270  response regulator  27.68 
 
 
238 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5410  putative response regulator  27.68 
 
 
238 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150801  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5114  response regulator  27.68 
 
 
238 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5667  response regulator  27.68 
 
 
238 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000414392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5597  putative response regulator  27.68 
 
 
238 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0176672  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2482  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.11 
 
 
288 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5541  putative response regulator  27.68 
 
 
238 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5211  LytTR family two component transcriptional regulator  28.57 
 
 
238 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2142  CO metabolism transcriptional regulator RcoM  31.53 
 
 
267 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3515  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
236 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2099  sensory box protein, putative  40 
 
 
232 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.374789  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.29 
 
 
245 aa  61.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3686  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.23 
 
 
251 aa  60.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3167  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.63 
 
 
285 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3930  LytTR family two component transcriptional regulator  26.79 
 
 
238 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  32.74 
 
 
236 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  30.97 
 
 
236 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  33.03 
 
 
236 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2397  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.54 
 
 
261 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1224  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.68 
 
 
260 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.36 
 
 
246 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0028  CO metabolism transcriptional regulator RcoM2  28.83 
 
 
267 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1561  putative PAS/PAC sensor protein  27.93 
 
 
249 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.925231 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0498  LytTR family two component transcriptional regulator  33.73 
 
 
236 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
245 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0399  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.36 
 
 
242 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.3 
 
 
257 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  29.69 
 
 
268 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2400  response regulator receiver protein  33.68 
 
 
236 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.14107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2784  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.02 
 
 
358 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  35.87 
 
 
249 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
253 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2542  putative PAS/PAC sensor protein  29.06 
 
 
268 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  31.96 
 
 
268 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  30.08 
 
 
246 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1209  putative integral membrane sensor protein  27.59 
 
 
368 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131047  normal  0.490878 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  26.61 
 
 
244 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  29.81 
 
 
272 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1533  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.97 
 
 
239 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.726215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>