More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS4072 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006274  BCZK3919  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  99.28 
 
 
690 aa  1382  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.346796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3910  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  99.42 
 
 
690 aa  1385  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4072  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  100 
 
 
690 aa  1390  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2861  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  86.09 
 
 
690 aa  1199  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4187  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  99.57 
 
 
690 aa  1385  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.32878e-11 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4239  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  98.12 
 
 
690 aa  1368  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0260  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  63.08 
 
 
687 aa  885  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4389  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  100 
 
 
690 aa  1390  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1683  transcriptional regulator  60.21 
 
 
588 aa  651  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0451023  normal  0.0113335 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0957  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  95.51 
 
 
690 aa  1301  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4297  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  97.68 
 
 
690 aa  1308  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4277  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  95.8 
 
 
704 aa  1306  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4008  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  93.62 
 
 
690 aa  1301  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06720  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  56.39 
 
 
581 aa  661  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2310  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  65.84 
 
 
688 aa  917  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0303  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  48.63 
 
 
576 aa  572  1e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.535404 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0018  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.73 
 
 
562 aa  537  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  2.32366e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0079  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.2 
 
 
564 aa  528  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0456  hypothetical protein  41.7 
 
 
586 aa  389  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1952  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.32 
 
 
545 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0808  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.68 
 
 
591 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000794554 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1911  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.1 
 
 
577 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2866  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.41 
 
 
703 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2667  sigma-54 dependent transcriptional regulator/sensory box protein  39.82 
 
 
668 aa  360  4e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2353  phosphocarrier HPr/sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  39.65 
 
 
668 aa  359  8e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0792  hypothetical protein  36.99 
 
 
662 aa  358  3e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  36.19 
 
 
698 aa  356  8e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2600  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.31 
 
 
585 aa  352  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4639  putative sigma54 specific transcriptional regulator  37.76 
 
 
574 aa  350  4e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2250  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.1 
 
 
571 aa  349  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.28606  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1487  sigma-L-dependent transcriptional regulator  35.84 
 
 
696 aa  344  4e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0399  putative PAS/PAC sensor protein  36.93 
 
 
695 aa  342  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0306  hypothetical protein  39.38 
 
 
582 aa  340  6e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  38.9 
 
 
710 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.72 
 
 
636 aa  336  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0512499  normal  0.510149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2816  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.36 
 
 
591 aa  330  5e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2683  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.39 
 
 
566 aa  328  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2055  transcriptional regulator  35.94 
 
 
600 aa  324  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.58727e-05  hitchhiker  0.000375363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1776  putative PAS/PAC sensor protein  38.61 
 
 
698 aa  323  9e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1438  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.79 
 
 
592 aa  320  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1051  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.82 
 
 
688 aa  313  5e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2688  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.56 
 
 
597 aa  313  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1492  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.2 
 
 
569 aa  311  3e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2710  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.41 
 
 
579 aa  310  5e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.077579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1719  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.94 
 
 
582 aa  309  1e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3598  proprionate catabolism activator, Fis family  40.43 
 
 
639 aa  308  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.00055082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3285  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.22 
 
 
609 aa  305  2e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1931  transcriptional regulator  33.72 
 
 
935 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0437  hypothetical protein  42.58 
 
 
453 aa  301  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.701644  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5404  proprionate catabolism activator, Fis family  39.22 
 
 
678 aa  301  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  4.63562e-05  normal  0.497573 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3051  transcriptional regulator  41.59 
 
 
465 aa  301  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1024  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.19 
 
 
544 aa  300  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  7.01357e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1494  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.02 
 
 
470 aa  298  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1204  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.57 
 
 
676 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.34686e-05  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1275  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.5 
 
 
709 aa  294  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2029  hypothetical protein  34.75 
 
 
554 aa  293  6e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1588  putative PAS/PAC sensor protein  37.42 
 
 
633 aa  293  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00103997  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0090  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.26 
 
 
541 aa  293  6e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00173924  hitchhiker  0.00306857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1326  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.9 
 
 
485 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2533  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.18 
 
 
483 aa  292  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2214  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.99 
 
 
592 aa  292  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.345711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1326  putative sigma54 specific transcriptional regulator  38.86 
 
 
540 aa  291  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.01296e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2629  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.9 
 
 
483 aa  291  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.55 
 
 
575 aa  290  5e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2442  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  47.55 
 
 
480 aa  290  8e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2771  proprionate catabolism activator, Fis family  38.6 
 
 
659 aa  289  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0968139  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1699  acetoin operon expression regulatory protein  36.5 
 
 
671 aa  288  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.263456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2741  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.42 
 
 
471 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4292  transcriptional regulator  39.34 
 
 
645 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964315  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3934  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.15 
 
 
501 aa  288  3e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534742  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0444  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.47 
 
 
482 aa  286  8e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2382  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.38 
 
 
539 aa  286  9e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0222564  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0663  putative PAS/PAC sensor protein  37.53 
 
 
527 aa  286  9e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1164  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.52 
 
 
501 aa  285  2e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.245431  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2162  putative sigma54 specific transcriptional regulator  43.84 
 
 
558 aa  283  5e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000345974 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0346  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.4 
 
 
468 aa  284  5e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.143008  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1807  PAS:helix-turn-helix, Fis-type:propionate catabolism activator, N-terminal  36.9 
 
 
663 aa  283  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.74 
 
 
651 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.191772  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0118  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.15 
 
 
591 aa  281  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2361  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.91 
 
 
450 aa  281  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0885  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.51 
 
 
661 aa  280  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0287148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  49.49 
 
 
456 aa  281  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3581  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.17 
 
 
467 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1910  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.9 
 
 
562 aa  280  9e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  8.22204e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2053  transcriptional regulator  32.63 
 
 
696 aa  279  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  6.40776e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0750  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  36.98 
 
 
576 aa  279  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0580  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.96 
 
 
494 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0570  NifA subfamily transcriptional regulator  43.98 
 
 
508 aa  276  1e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.106051  normal  0.50757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2984  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.94 
 
 
458 aa  275  2e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.826768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0427  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.92 
 
 
458 aa  274  4e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1486  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.44 
 
 
525 aa  274  4e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0842644  hitchhiker  1.47012e-08 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2790  sigma-54 dependent sensory box protein  36.19 
 
 
650 aa  274  5e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2834  sigma-54 dependent transcriptional regulator/sensory box protein  37.56 
 
 
474 aa  273  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.653087  normal  0.743395 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0357  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.35 
 
 
651 aa  273  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36000  propionate catabolism operon regulator  36.19 
 
 
473 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0249569  hitchhiker  2.35786e-13 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0494  arginine utilization regulatory protein RocR  34.78 
 
 
467 aa  273  8e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0207155  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1785  NifA subfamily transcriptional regulator  46.75 
 
 
507 aa  273  9e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3577  putative sigma54 specific transcriptional regulator  37.47 
 
 
550 aa  272  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5989  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.56 
 
 
459 aa  272  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999422  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2865  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  35.88 
 
 
553 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0882219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>